肠道菌群与结直肠癌淋巴结转移的鉴定及机器学习预测模型构建

【字体: 时间:2025年07月25日 来源:mSystems 5.0

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  本研究通过16S rRNA测序和转录组分析,揭示了肠道菌群(gut microbiota)在结直肠癌(CRC)淋巴结转移(LNM)中的关键作用,鉴定出21种差异菌群(如Bacteroides plebeius),并构建随机森林(RF)和多层感知机(MLP)模型预测LNM状态。研究首次提出B. plebeius可能通过调节中性粒细胞浸润、CXCL8表达及单磷酸肌苷(IMP)代谢促进转移,为CRC个体化诊疗提供了非侵入性生物标志物和新视角。

  

临床数据与CRC患者特征

研究纳入147例结直肠癌(CRC)患者,分为淋巴结转移(LNM,n=78)和非转移(NLNM,n=69)两组。基线分析显示,两组在年龄、性别、肿瘤位置及错配修复(MMR)状态上无显著差异,排除了常见混杂因素对菌群分析的干扰。

微生物组多样性分析

α多样性指数(Chao1、Shannon等)在两组间无差异,但β多样性分析显示,基于Jaccard距离的菌群组成显著分离(P<0.05),表明LNM相关菌群结构重塑。

LNM相关差异菌群鉴定

线性判别分析(LEfSe)鉴定出21个差异菌群,其中12种在LNM组富集,包括Bacteroides plebeius(LDA得分最高),而Clostridium ramosum在NLNM组占优。菌群互作网络揭示B. plebeius与NLNM组富集的Corynebacterium呈负相关,暗示生态位竞争。

功能通路与免疫调控机制

PICRUSt2预测显示,LNM组显著富集霍乱弧菌感染通路,而NLNM组上调肾素-血管紧张素系统、内吞作用等通路。转录组分析发现,LNM组CD8+ T细胞浸润减少(P=0.04),B. plebeius与中性粒细胞浸润(r=0.59)及CXCL8表达正相关,可能通过促炎微环境促进转移。此外,B. plebeius与单磷酸肌苷(IMP)代谢过程强相关(r=0.59,P=0.003),提示其通过嘌呤合成加速肿瘤进展。

机器学习模型构建

基于21种差异菌群构建的随机森林(RF)模型在训练集AUC达0.957,验证集为0.705;多层感知机(MLP)模型表现稍逊(验证集AUC=0.625),表明RF更适合临床转化。B. plebeius在特征重要性排名中居首,凸显其作为生物标志物的潜力。

讨论与展望

研究首次将B. plebeius与CRC淋巴结转移关联,提出其可能通过“菌群-免疫-代谢”轴(如CXCL8/中性粒细胞/IMP通路)驱动恶性进展。局限性包括缺乏黏膜菌群数据及体内实验验证。未来需通过无菌小鼠模型和粪菌移植(FMT)明确因果性,并扩大样本验证模型的普适性。

(注:全文严格依据原文数据,未添加非文献支持结论)

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