视黄醇驱动基因特征预测肺腺癌预后并揭示PAICS作为治疗靶点的新机遇

【字体: 时间:2025年07月25日 来源:Phenomics 3.7

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  研究人员通过整合TCGA和GEO数据库数据,深入探究视黄醇代谢在肺腺癌(LUAD)中的调控机制。基于视黄醇代谢基因集的无监督聚类将患者分为预后显著差异的两组,鉴定出349个差异突变基因和394个差异表达基因,并构建7基因预后模型。研究发现高危患者对吉非替尼和厄洛替尼更敏感,首次证实PAICS基因在促进癌细胞增殖迁移中的关键作用,为LUAD精准治疗提供新靶点。

  

视黄醇作为细胞生长和凋亡的关键调控因子,在癌症发展中扮演复杂角色。这项研究通过分析癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)的海量数据,首次系统解析了维生素A代谢在肺腺癌(LUAD)进展中的分子机制。基于视黄醇代谢相关基因集的聚类分析成功将患者分为两个具有显著生存差异的亚群,其中cluster 1组患者预后明显较差。差异分析揭示两组间存在349个突变差异基因和394个表达差异基因。

研究者据此建立了一个包含7个关键基因的预后预测模型,该模型能准确识别高风险患者,并在四个独立GEO队列中得到验证。药物敏感性分析显示,高风险患者对表皮生长因子受体抑制剂吉非替尼(gefitinib)和厄洛替尼(erlotinib)表现出更高敏感性。尤为重要的是,通过整合LUAD细胞系的基因依赖性评分和RNA-seq数据,首次鉴定出磷酸核糖氨基咪唑羧化酶/琥珀酰羧酰胺合成酶(PAICS)这一潜在治疗靶点。

单细胞RNA测序证实PAICS在癌细胞中特异性高表达,功能实验则揭示该基因通过促进细胞增殖、迁移和侵袭发挥促癌作用。这些创新发现不仅为预后不良的LUAD患者提供了新的治疗思路,更为开发靶向PAICS的精准疗法奠定了理论基础。该研究通过多组学整合分析策略,成功搭建了从基础研究到临床转化的桥梁。

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