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本文揭示 piENOX2 在类风湿关节炎(RA)中高表达,通过靶向降解 Alkbh5 mRNA,影响 Itga4 的 m?A 修饰及 PI3K-AKT 通路,调控巨噬细胞极化。其抑制剂可缓解 RA,为 RA 治疗提供新靶点与思路。
类风湿关节炎与 piRNA 的研究背景
类风湿关节炎(RA)是一种慢性自身免疫性疾病,以滑膜炎为特征,主要影响四肢小关节,可导致关节畸形和功能障碍。活化的滑膜巨噬细胞会促进炎症和组织损伤,目前的治疗药物面临并发症和复发等挑战,亟需新的治疗靶点和对发病机制的深入理解。
PIWI 相互作用 RNA(piRNA)是 2006 年发现的一类小非编码 RNA,通过 piRNA/PIWI 复合体调控转座元件、表观遗传修饰和蛋白质调控。其功能失调与生殖疾病、癌症、神经发育障碍等多种疾病相关,但在 RA 发病机制中的作用尚未明确。本研究聚焦于巨噬细胞来源的 piENOX2 在 RA 中的作用及机制。
材料与方法
DAS-28 评估:采用疾病活动度评分(DAS-28)评估 RA 患者的疾病活动度,该评分结合了 28 个关节的压痛数(TJC28)、肿胀数(SJC28)、血沉(ESR)和患者整体健康状况(GH),计算公式为 DAS-28=0.56×√TJC28 + 0.28×√SJC28 + 0.70×ln (ESR) + 0.014×GH。
胶原诱导关节炎(CIA)模型:对 6-8 周龄雄性 DBA1/J 小鼠诱导 CIA,将完全弗氏佐剂与牛 Ⅱ 型胶原乳剂皮内注射,21 天后用不完全弗氏佐剂与胶原乳剂加强免疫,对照组注射生理盐水。
piRNA 测序:加强免疫 2 周后处死小鼠,收集膝关节滑膜组织,经 RNA 提取、反转录、PCR 扩增和文库构建后,用 Illumina HiSeq 2500 平台测序,对测序数据进行过滤、比对、注释及差异表达分析,并对预测的 piRNA 靶基因进行 GO 和 KEGG 富集分析。
荧光原位杂交(FISH):使用 Cy3 标记的 piENOX2 荧光探针,对 RA 患者和对照组的滑膜组织切片进行杂交,DAPI 染色后在荧光显微镜下观察 piENOX2 的表达和分布。
piRNA 筛选:经伦理委员会批准,收集 RA 患者和骨关节炎患者的滑膜组织,通过 piRBase 比对小鼠和人类 piRNA 序列,筛选出显著差异表达的 piRNA,设计合成模拟物和抑制剂,在脂多糖(LPS)处理的细胞中评估其对 IL-1β、IL-6 和 TNF 等炎症因子的影响。
组织收集与流式细胞术:收集 CIA 小鼠滑膜组织,经胶原酶和 DNase 消化后过滤、离心,获得单细胞悬液,染色后通过流式细胞术分析细胞群体。
骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)培养:从小鼠后肢骨髓中提取细胞,用含巨噬细胞集落刺激因子的培养基培养,获得 BMDMs 用于后续实验。
Man/LNP@piENOX2 INH 的构建与表征:制备 citrate 缓冲液,将 piENOX2 抑制剂(piENOX2 INH)与磷脂 - 乙醇溶液通过微流控装置混合,经超滤后加入 DSPE-PEG-Man,评估其粒径、包封率等特性。
体内小动物成像:对 CIA 小鼠尾静脉注射吲哚菁绿(ICG)标记的 Man/LNP@piENOX2 INH,通过小动物活体成像系统监测荧光分布,评估其靶向性。
体内治疗实验:对 CIA 小鼠每 3 天注射 Man/LNP@piENOX2 INH,共 6 次,监测爪厚度和关节炎评分,处死小鼠后收集血清、淋巴结和后肢样本进行分析。
甲基化 RNA 免疫沉淀测序(meRIP-seq)和定量 PCR(meRIP-qPCR):通过 meRIP-seq 分析 m?A 修饰的 RNA 片段,结合 SRAMP 数据库预测 Itga4 的 m?A 位点,设计引物进行 meRIP-qPCR 验证。
统计学分析:实验至少重复 3 次,数据以均值 ± 标准差表示,用 GraphPad Prism 8.0 分析,两组比较用 t 检验,多组比较用单因素方差分析及多重比较检验,P<0.05 为差异有统计学意义。
研究结果
- 巨噬细胞来源的 piENOX2 在 RA 发病和进展中起重要作用
在 CIA 小鼠模型中,通过 piRNA 测序发现 RA 患者和 CIA 小鼠滑膜组织中 piENOX2 表达升高。RT-qPCR 验证了 piENOX2 在 RA 患者滑膜组织中的高表达,且其表达水平与 DAS-28 评分呈显著正相关。
流式细胞术和 FISH 分析显示,巨噬细胞是滑膜组织中 piENOX2 的主要来源,piENOX2 模拟物(piENOX2 MIM)促进巨噬细胞 M1 极化(增加 F4/80?CD86?细胞及 iNOS、IL-1β 等 M1 标志物),而抑制剂(piENOX2 INH)促进 M2 极化(增加 F4/80?CD206?细胞及 ARG1、TGF-β 等 M2 标志物)。
- 巨噬细胞靶向的 piENOX2 INH 脂质体前药(Man/LNP@piENOX2 INH)有效缓解 CIA 小鼠疾病进展
构建的 Man/LNP@piENOX2 INH 具有良好的靶向性,在 CIA 小鼠关节和爪部富集。体内治疗实验显示,该制剂显著减轻爪肿胀,降低关节炎评分,抑制滑膜组织增生和浸润,保护软骨结构完整性,减少骨丢失。
同时,Man/LNP@piENOX2 INH 可调节免疫稳态,恢复 CD4?/CD8? T 细胞比例,增加调节性 T 细胞(Treg)、减少 Th17 细胞,降低血清和滑膜组织中促炎因子水平,提高 IL-10 水平。
- piENOX2 通过靶向 Alkbh5 mRNA 调控巨噬细胞极化
生物信息学分析发现 piENOX2 可与 Alkbh5 mRNA 互补结合,分子对接验证了 piENOX2 与 PIWI 蛋白及 Alkbh5 mRNA 的结合。实验显示,piENOX2 MIM 降低 Alkbh5 的 mRNA 和蛋白水平,piENOX2 INH 则升高其水平。
Alkbh5 敲低可抑制 piENOX2 INH 对 M2 极化的促进作用,而 Alkbh5 过表达可阻断 piENOX2 MIM 对 M1 极化的促进作用,表明 piENOX2 通过靶向降解 Alkbh5 mRNA 调控巨噬细胞极化。
在髓系细胞特异性敲除 Alkbh5 的 CIA 模型小鼠中,Man/LNP@piENOX2 INH 的治疗效果降低
构建 Alkbh5 条件性敲除(Alkbh5 cKO)小鼠的 CIA 模型,发现与 Alkbh5flox/flox小鼠相比,Alkbh5 cKO 小鼠中 Man/LNP@piENOX2 INH 缓解爪肿胀、降低关节炎评分、保护关节结构及调节免疫和炎症的作用显著减弱,证实 ALKBH5 在 Man/LNP@piENOX2 INH 的治疗机制中不可或缺。
piENOX2 调控 ALKBH5 介导的 Itga4 mRNA m?A 修饰,通过 PI3K-AKT 信号通路影响巨噬细胞极化
meRIP-seq 和 meRIP-qPCR 显示,piENOX2 MIM 增加 Itga4 mRNA 的 m?A 修饰水平,piENOX2 INH 则降低其水平,且 ALKBH5 表达影响 Itga4 的 m?A 状态。piENOX2 MIM 下调 ITGA4 的 mRNA 和蛋白水平,piENOX2 INH 则上调。
机制上,piENOX2 INH 通过激活 PI3K-AKT 通路促进 M2 极化,敲低 Itga4 或使用 PI3K-AKT 抑制剂可阻断该效应;在 M1 极化模型中,piENOX2 INH 对 M1 极化的抑制作用也因 Itga4 敲低或通路阻断而减弱,表明 piENOX2 通过调控 Itga4 的 m?A 修饰及 PI3K-AKT 通路影响巨噬细胞极化。
讨论
本研究首次发现 piENOX2 在 RA 中的作用,其在 RA 患者和 CIA 小鼠滑膜组织中高表达,通过促进巨噬细胞 M1 极化加剧炎症。构建的巨噬细胞靶向递送系统 Man/LNP@piENOX2 INH 可有效缓解 CIA 小鼠的 RA 症状,为 RA 治疗提供了新策略。
机制上,piENOX2 与 PIWI 蛋白形成复合体,靶向降解 Alkbh5 mRNA,降低 ALKBH5 表达,导致 Itga4 mRNA 的 m?A 修饰增加、稳定性降低,ITGA4 表达减少,进而抑制 PI3K-AKT 通路,促进巨噬细胞 M1 极化,加速 RA 进展。这一发现揭示了 piRNA 在 RA 中的表观遗传调控机制,为开发 RA 精准治疗药物提供了重要靶点和理论依据。
生理状态下,ALKBH5 通过去甲基化稳定 Itga4 mRNA 表达,激活 PI3K-AKT 通路,促进巨噬细胞 M2 极化,维持免疫稳态;而在 RA 中,piENOX2 高表达破坏这一平衡,推动疾病发展。该研究不仅拓展了 piRNA 在自身免疫性疾病中的研究领域,也为理解 RA 的发病机制提供了新的表观遗传学视角。