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程序性细胞死亡特征驱动的阿尔茨海默病小胶质细胞转化:单细胞转录组学与功能验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月26日 来源:Frontiers in Immunology 5.9
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这篇综述通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据,结合机器学习框架构建了程序性细胞死亡特征(PCDS)模型(AUC=0.832),揭示了S100A4通过调控小胶质细胞炎症反应(IL-6/TNF-α↓,IL-10/ARG1↑)和氧化应激(ROS/SOD/GSH-Px)在阿尔茨海默病(AD)中的关键作用,为早期诊断和靶向治疗提供了新策略。
阿尔茨海默病(AD)作为不可逆的神经退行性疾病,其核心病理特征包括β淀粉样蛋白(Aβ)沉积和tau蛋白异常磷酸化。近年研究发现,程序性细胞死亡(PCD)的异常激活与AD进展密切相关,但缺乏系统性研究。本研究通过整合多组学数据,首次构建了涵盖17种PCD模式的分子特征模型,并深入解析了关键基因S100A4的调控机制。
研究团队分析了来自GEO数据库的5个bulk RNA-seq数据集(GSE132903等)和1个scRNA-seq数据集(GSE157827),筛选出1554个PCD相关基因。采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定AD相关模块(MEblue,R=-0.46),最终锁定77个关键基因。通过集成12种机器学习算法(包括随机森林、XGBoost等)构建PCDS模型,并在独立队列(GSE122063)中验证(AUC=0.938)。体外实验采用Aβ寡聚体(AbetaO)诱导的BV2小胶质细胞模型,通过siRNA敲降、流式细胞术、免疫荧光等技术验证S100A4功能。
单细胞层面:AD患者小胶质细胞中11种PCD模式(如铁死亡、坏死性凋亡)显著激活。模型效能:最优PCDS包含9个基因(CFLAR、S100A4等),在训练集和验证集的F1分数均>0.75。机制解析:
该研究创新性地将PCD特征与微环境重塑关联:
研究证实PCDS可作为AD分层的生物标志物,而靶向S100A4能通过"抗氧化-抗炎-线粒体保护"三联机制改善病理进程。未来需在转基因动物模型中进一步验证其跨物种保守性。
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