开源工具DICOMator:基于3D网格生成合成DICOM CT图像推动医学物理研究

【字体: 时间:2025年07月26日 来源:Physical and Engineering Sciences in Medicine 2.4

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  为解决医学影像数据获取受限的伦理和技术难题,Michael John James Douglass团队开发了开源Blender插件DICOMator,可将3D网格模型转化为含模拟伪影的合成DICOM CT数据。该工具支持4D CT生成,验证了其在放疗计划系统(如Raystation)中剂量计算和图像配准的实用性,为医学物理研究提供了可定制化数据解决方案。

  

在医学影像和放射治疗领域,真实患者CT数据的获取长期面临伦理审批复杂、数据稀缺等瓶颈。尤其在进行机器学习模型训练、放疗计划验证等研究时,现有开源数据集往往难以满足特定研究需求。传统解决方案依赖物理模体或简化数字模型,但存在成本高、灵活性差等问题,无法模拟复杂解剖结构动态变化(如呼吸运动)。如何快速生成兼具真实性和可定制性的合成CT数据,成为医学物理研究的关键挑战。

阿德莱德大学(University of Adelaide)物理科学学院联合皇家阿德莱德医院医学物理部开发的DICOMator插件,创新性地将Blender三维建模能力与医学影像标准相结合。这项发表于《Physical and Engineering Sciences in Medicine》的研究表明,该工具能通过自适应体素化算法将3D网格转化为含Hounsfield单位(HU)值的合成CT序列,并模拟金属伪影、噪声等常见CT成像问题。特别值得注意的是,其4D CT功能首次实现了在开源环境中创建呼吸运动相位数据集,为动态放疗研究提供了新范式。

研究团队采用三项核心技术:1)基于光线投射(ray casting)的双阶段体素化算法,先通过低分辨率采样确定结构边界,再对边界区域进行高精度采样;2)多伪影模拟模块,包括高斯噪声(σ=5 HU)、金属伪影径向衰减模型等;3)DICOM元数据集成,支持生成符合DICOM标准的CT序列。测试数据来源于CERMEP-IDB-MRXFDG和Visible Human Project等公开数据库的匿名化影像。

主要研究结果
简单肺模体验证
通过两套位移差2 cm的合成肺CT验证,Raystation中形变配准(DIR)测量的位移误差仅0.055 cm,证实工具生成的动态数据集可用于影像配准算法验证。金属伪影模拟功能成功复现临床常见的放射状条纹伪影。

合成颅脑CT应用
基于Total Segmentator分割的颅骨、脑组织模型(图4)生成的合成CT,在Raystation中经HU-密度转换后,报告的头骨密度(1.66 g/cm3)与临床实测值吻合。创建的3°倾斜颅骨CT经刚性配准后测得偏差仅0.1°,验证了工具在空间精度验证中的价值。

4D胸部CT实现
通过Blender晶格变形模拟呼吸运动(图5),生成的10相位4D CT数据集可被放疗计划系统直接识别,用于评估膈肌位移等动态参数。与原始患者CT对比显示(图9),合成数据在几何结构上具有高度相似性,但受限于均匀HU赋值,未能再现支气管等细微结构。

结论与展望
该研究突破性地将专业3D建模工具转化为医学物理研究平台,其核心价值体现在:1)伦理规避性,通过合成数据替代敏感患者影像;2)动态模拟能力,4D CT功能支持呼吸运动管理等前沿研究;3)开源生态优势,基于Blender-Python的架构便于功能扩展。当前版本在组织异质性模拟、GPU加速等方面存在局限,未来通过整合多模态成像(MRI/PET)模拟和基于物理的伪影模型,有望成为医学影像研究的基准工具。值得注意的是,研究者特别强调合成数据用于机器学习训练时需警惕"真实性鸿沟",建议采用"预训练-微调"策略结合真实临床数据验证模型性能。这项技术不仅为放疗计划系统验证提供了新范式,其开源特性更将加速全球医学物理研究的协作创新。

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