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多器官衰老评估新模型2A揭示器官衰老异质性及潜在抗衰老药物筛选
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月26日 来源:Genome Medicine 10.4
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本研究针对器官衰老评估缺乏时空动态性和异质性的问题,开发了基于小鼠多器官转录组图谱的2A衰老评估模型。通过系统分析16个器官的衰老轨迹基因,揭示了免疫失调和程序性细胞死亡是器官衰老的关键驱动因素,并筛选出Fostamatinib、Ranolazine和Metformin等潜在抗多器官衰老药物,为精准抗衰老干预提供了新策略。
衰老是机体功能随年龄增长逐渐衰退的复杂过程,不同器官的衰老速率和特征存在显著差异。然而,传统研究多局限于年轻与老年群体的简单对比,难以捕捉衰老过程的动态性和器官特异性。更关键的是,现有衰老评估模型主要依赖血液或皮肤等易获取样本,无法反映器官层次的衰老异质性。这些局限性严重制约了精准抗衰老干预策略的开发。
哈尔滨医科大学(Harbin Medical University)生物信息科学与技术学院的研究团队在《Genome Medicine》发表重要成果,通过构建小鼠多器官衰老图谱,系统分析了16个器官的衰老轨迹,开发出新型多器官衰老评估模型(2A模型)。该研究不仅揭示了器官衰老的分子异质性,还筛选出具有多器官保护潜力的候选药物,为衰老机制研究和临床干预提供了重要工具。
研究采用多组学整合分析策略,关键技术包括:(1)整合GSE132040等9个小鼠和人类转录组数据集;(2)运用ImpulseDE2和Mfuzz算法识别器官特异性衰老趋势基因(Aging Trend Genes, ATGs);(3)开发基于全局衰老趋势基因(Global Aging Trend Genes, GATGs)的2A评分模型;(4)结合随机游走算法和基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)筛选抗衰老药物;(5)利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)验证模型在细胞类型特异性衰老评估中的性能。
识别器官衰老趋势基因的功能特征
研究团队通过分析16个小鼠器官的时空转录组数据,发现不同器官呈现独特的衰老轨迹基因表达模式。肺和肾脏对衰老最为敏感,其衰老趋势基因显著富集于细胞死亡和免疫炎症通路。值得注意的是,小肠道含有最多的衰老趋势基因(1,389个),而胰腺仅有10个上调基因。通过共识聚类分析,研究人员发现除大脑呈现三相衰老轨迹外,其余15个器官均表现为从年轻状态(State 1)向衰老状态(State 2)的双相转变,其中脾脏和肾脏早在出生后9个月就启动衰老程序。
免疫衰老的细胞基础
免疫浸润分析揭示,衰老过程中浆细胞(plasma cells)比例与年龄呈显著正相关,而CD4+ naive T细胞则呈现负相关。单细胞轨迹分析显示,衰老促使脾脏B细胞向终末浆细胞分化,同时幼稚样淋巴细胞耗竭。这种"双向失衡"通过浆细胞过度分泌抗体和激活B细胞减少共同导致免疫功能衰退。BayesPrism算法反卷积进一步证实,衰老器官中浆细胞和树突状细胞(DCs)持续积累,而NK T细胞和幼稚CD4+/CD8+ T细胞比例逐渐下降。
2A模型的构建与验证
研究团队鉴定出114个在至少4个器官中表现一致趋势的全局衰老趋势基因(GATGs),包括免疫相关基因Ighm、Rbm3和胶原合成基因Col3a1等。基于这些基因构建的2A模型在跨物种验证中表现优异:在人类GTEx数据集中,2A评分能准确区分年轻(20-39岁)和老年(60-79岁)组样本(p<0.001);在预测衰老细胞清除效率方面,ATM抑制剂KU-60019处理后2A评分显著降低(p=0.00075)。单细胞水平评估显示,2A模型在肺组织中的性能优于sc-ImmuAging和SCALE时钟,特别是在毛细血管内皮细胞和II型肺泡上皮细胞中相关性最高(R=0.49和0.41)。
抗衰老药物筛选
通过整合重启随机游走算法和CMap数据库,研究筛选出多个潜在抗多器官衰老药物。其中,SYK抑制剂Fostamatinib在13个器官中显示抗衰老潜力,主要通过抑制B细胞受体信号通路延缓浆细胞终末分化。代谢调节剂Metformin和Ranolazine分别通过AMPK/mTORC1轴和PPAR-δ/CPT1β通路发挥抗衰老作用。这些药物共同靶向长寿调控、昼夜节律和自噬等核心衰老相关通路。
该研究建立的2A模型首次实现了器官衰老状态的动态量化评估,其创新性体现在三个方面:首先,突破传统"年轻-老年"二分法局限,捕捉衰老的连续动态过程;其次,揭示"发育-防御转换"的衰老核心特征,即从合成代谢主导的发育程序转向炎症防御主导的生存策略;最后,开发的药物筛选框架为个性化抗衰老干预提供新思路。研究发现的浆细胞积累和幼稚淋巴细胞耗竭机制,为理解免疫衰老提供了新视角。这些成果不仅深化了对器官衰老异质性的认识,也为开发精准抗衰老疗法奠定了理论基础。