综述：脑脊液基因组分析在中枢神经系统肿瘤管理中的临床效用验证——文献Meta分析

这篇综述通过Meta分析系统评估了脑脊液（CSF）基因组分析（ctDNA/cfDNA）在中枢神经系统（CNS）肿瘤诊断和管理中的临床价值，重点比较了靶向测序（NGS）与商业检测（如Belay Summit?）的敏感性（88%原发性/95%转移性）和特异性（95%），为突破血脑屏障（BBB）限制的液体活检提供了循证依据。

　　

引言
中枢神经系统（CNS）肿瘤约占美国新发癌症的1.3%，但死亡率居高不下。传统诊断依赖侵入性组织活检，而血脑屏障（BBB）限制了血浆检测的敏感性。脑脊液（CSF）因富含肿瘤释放的循环肿瘤DNA（ctDNA）成为理想替代样本。本文通过Meta分析63项研究（65队列，4387例样本），探讨CSF基因组分析的临床潜力。

方法
采用PRISMA框架检索PubMed，纳入标准包括：成人CNS肿瘤、CSF DNA检测、≥10例样本。排除儿科病例和综述类文献。分析指标涵盖DNA输入量（1-100ng）、检测技术（NGS/ddPCR）、生物标志物（111基因）及性能参数。

结果

1. 技术特征：76%研究使用ctDNA，45项采用靶向NGS面板（>6基因）。MSK-IMPACT等商业面板占比57%，但灵敏度中位数仅47±1.95%（原发性）/71±0.76%（转移性）。
2. 疾病谱：原发性肿瘤中胶质瘤占76%（560/738），转移性肿瘤中肺癌占67%（1209/1807）。
3. 分子图谱：
   • 高频突变：EGFR（39研究，转移性为主）、TP53（23研究）和PIK3CA（12研究）；
   • 独特性变异：MYD88/PTEN（原发性专属）、KRAS/MET扩增（转移性专属）；
   • 融合基因：ALK/ROS1仅见于转移病例。
4. 性能比较：Belay Summit?测试通过双链测序技术检测32基因+染色体非整倍性，灵敏度显著优于传统NGS（原发性88% vs 47%；转移性95% vs 71%）。

讨论
CSF检测的敏感性受肿瘤负荷、分期及位置影响。关键优化方向包括：

• 面板设计：涵盖NCCN/WHO指南78基因中的27个（如EGFR、IDH1）；
• 方法学：双链测序提升低频变异检出；
• 质控：需纳入真阴性对照排除克隆性造血（CHIP）干扰。现有商业测试中，Summit?因多分析物策略（基因变异+染色体异常）展现最佳阳性检出率（90%）。

结论
CSF基因组分析可有效指导CNS肿瘤的精准治疗，尤其适用于无法获取组织样本的病例。未来需扩大队列验证多组学（如甲基化/外泌体）联合检测的价值，推动液体活检成为CNS肿瘤管理的标准工具。