新型苯并色烯类衍生物的设计合成及其通过DNMT1表观调控机制展现的多靶点抗肿瘤活性研究

【字体: 时间:2025年07月26日 来源:Results in Chemistry 2.5

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  本研究针对抗癌药物开发中的疗效与安全性平衡难题,设计合成了一系列苯并色烯(benzochromene)、苯并色烯并嘧啶(benzochromenopyrimidine)和苯并色烯三唑并嘧啶(benzochromeno-triazolopyrimidine)衍生物。通过MTT法证实化合物11(含甲基)和12(含氨基)对HepG-2、HCT-116和MCF-7细胞系的IC50值显著优于5-Fluorouracil和Doxorubicin。分子对接揭示其通过靶向DNA甲基转移酶1(DNMT1)发挥表观遗传调控作用,ADMET预测显示优良的肠道吸收特性,为开发新型多靶点抗癌药物提供了候选分子。

  

癌症治疗领域长期面临传统化疗药物选择性差、毒副作用大的挑战,尤其针对肝癌(HepG-2)、结肠癌(HCT-116)和乳腺癌(MCF-7)等常见恶性肿瘤,亟需开发兼具高效性和安全性的新型靶向药物。苯并色烯类化合物因其独特的稠环结构和多样的生物活性,已成为抗癌药物研发的重要骨架,但其结构优化和机制研究仍有巨大探索空间。

沙特阿拉伯吉赞大学(Jazan University)的研究团队在《Results in Chemistry》发表创新性研究,通过巧妙的分子设计将苯并色烯与嘧啶、三唑等杂环耦合,构建了12个新型衍生物(4a,b-14)。研究采用三步技术路线:首先通过多组分缩合反应构建苯并色烯核心骨架;接着运用MTT法评估化合物对三种癌细胞系的增殖抑制活性;最后通过分子对接和ADMET模拟预测阐明作用机制和成药性。

4.1 化学合成
研究以2,7-萘二酚为起始原料,通过Piperidine催化的三组分反应高效构建了含氰基(4a)和酯基(4b)的苯并色烯骨架。关键中间体8经胺解、环化等反应,成功获得含甲基(11)和氨基(12)的苯并色烯并嘧啶衍生物,所有结构均经1H/13C NMR和质谱确证。

4.2 抗肿瘤评价
MTT实验显示化合物11和12展现出广谱强效活性,对HepG-2细胞的IC50分别达1.03和0.92 μg/mL,较阳性药5-Fluorouracil(10.01 μg/mL)提高10倍。结构-活性关系(SAR)分析揭示:C-2位氰基、C-3位氨基的保留及嘧啶环的引入是活性关键,而三唑并嘧啶结构(13-14)会导致活性骤降。

5.1 分子对接
选择DNMT1(PDB 4WXX)为靶点,发现11和12能精准占据SAH结合口袋:11通过C-9羟基与GLU1168形成氢键(1.86 ?),12的N-10氨基与GLN1227产生更强相互作用(1.92 ?)。结合能分别达-37.369和-40.45 kcal/mol,与天然配体SAH(-48.56 kcal/mol)相当。

6.1 ADMET预测
SwissADME分析显示两化合物符合Lipinski五规则,但存在显著差异:11存在广谱CYP抑制风险(7种亚型),而12虽降低CYP抑制却显示hERG阻滞(概率0.751)和肝毒性预警(DILI概率0.798)。

这项研究的意义在于:首次系统阐明了苯并色烯并嘧啶类化合物通过DNMT1表观调控的抗癌机制,化合物12的IC50突破1 μg/mL大关,为开发表观遗传靶向药物提供了先导结构。尽管存在毒性隐患,但通过C-10位修饰优化,有望获得更安全的候选药物。该成果为多靶点抗癌药物的设计提供了新思路,其"杂环融合增强活性"的策略可拓展至其他抗癌药物研发领域。

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