藻类培养中捕食性寡养菌(Oligoflexus)的全基因组测序及其对微藻产业的威胁解析

来自美国的研究团队针对微藻大规模培养中频发的病原体感染问题，对一株侵染经济藻类Nannochloropsis salina的捕食性细菌FD111进行全基因组解析。通过Hi-C辅助的Illumina NovaSeq测序技术，成功组装出6.26 Mb的Oligoflexus类细菌基因组(含5,249个CDS)，BUSCO评估显示88.5%完整度。该研究为防控微藻培养的BALO(Bdellovibrio-and-like-organisms)病原体提供了关键分子靶点。

　　

在微藻工业化养殖领域，Nannochloropsis salina作为生物燃料和化妆品原料的重要来源，其露天培养系统却频繁遭遇神秘病原体袭击。2015年美国新墨西哥州藻塘爆发的大规模感染事件中，研究人员捕获到一株行为诡异的细菌刺客——它能在3-7天内使藻细胞密度(OD值)断崖式下跌，并迅速漂白培养液。

通过ZYMObiotics DNA试剂盒提取的病原体DNA，经Illumina NovaSeq平台进行双端150bp测序。研究团队巧妙运用Hi-C染色体构象捕获技术(Phase Genomics ProxiMeta Kit v4.0)，像拼图大师般将零散的测序碎片组装成6,263,897bp的基因组拼图。这个藏在藻塘里的"隐形杀手"最终被基因身份证实属于Oligoflexus家族，其2.8Mb的核心基因组藏着5,249个可能编码致命武器的基因。

令人警惕的是，BUSCO评估显示这个基因组藏着131个保守基因(占88.5%)，就像犯罪现场的完整指纹库。GTDB-tk数据库虽确认其属于Bdellovibrionota门下的Oligoflexia纲，但这个微生物界的"职业杀手"仍拒绝透露更详细的户籍信息。研究者特别采用qPCR探针锁定两条最大contig，确保没有"替罪菌"混入证据链。

这项由美国能源部资助的研究，不仅揭示了藻类养殖场里的微观"狼群"，更为开发针对BALO类病原体的基因检测试剂盒铺平了道路。当微藻培养罐变成6.26Mb基因组的狩猎场，科学家们正在用测序仪编织防护网。