绿海龟(Chelonia mydas)未孵化死卵与巢沙细菌多样性研究：揭示孵化成功率的环境微生物影响因素

来自东地中海Samanda?海滩的研究人员针对绿海龟孵化成功率受环境微生物影响的问题，通过高通量测序技术分析了8个巢穴中未孵化死卵与巢沙的16S rRNA基因V3-V4区段。研究发现巢沙与死卵样本存在显著微生物组成差异，首次检出木糖氧化无色杆菌(Achromobacter xylosoxidans)和蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)，揭示了致病菌丰度与孵化成功的潜在关联。

　　

海龟对环境生物化学变化异常敏感，其卵壳的特殊渗透性使胚胎发育直接受巢沙微生物群落影响。这项开创性研究采用新一代测序技术(NGS)，对东地中海Samanda?海滩8个绿海龟巢穴的未孵化死卵和巢沙样本进行16S核糖体RNA(16S rRNA)V₃-V₄可变区测序。

分析显示巢沙与死卵样本存在显著菌群差异，23种细菌在巢沙中显著富集。虽然α多样性分析显示孵化成功率无统计学差异(PERMANOVA, p > 0.05)，但β多样性呈现显著分化(p < 0.05)。研究团队首次在绿海龟巢环境中鉴定出两种潜在致病菌——木糖氧化无色杆菌(A. xylosoxidans)和蜂房哈夫尼菌(H. alvei)，这些发现为解释海龟胚胎死亡率提供了新视角。

值得注意的是，研究通过主坐标分析(PCoA)发现两组样本虽存在统计学差异，但其95%置信区间的椭圆分布存在重叠，暗示环境微生物与卵内菌群的复杂互作关系。这些发现强调了评估海岸线微生物污染对濒危海龟种群保护的重要性，为制定基于微生物组管理的保护策略提供了科学依据。