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大豆(Glycine max L.)抗旱关键基因的转录因子(TFs)鉴定与基因本体(GO)功能解析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月28日 来源:Biology Bulletin 0.5
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本研究针对大豆抗旱分子机制未明的问题,通过生物信息学手段解析了关键转录因子(TFs)网络。研究人员利用R语言分析大豆微阵列数据,结合Venny v2.1工具鉴定出AT-Hook、WRKY等上调TFs和bZIP、bHLH等下调TFs,发现脂肪酸代谢与光合作用相关基因上调,而胁迫响应基因下调。该研究为作物抗逆育种提供了重要靶点。
转录因子(TFs)作为调控干旱胁迫响应基因的关键蛋白,能特异性结合启动子区域DNA元件。这项研究首次采用组合分析方法,通过R语言包处理大豆微阵列数据,系统鉴定了抗旱相关的上下调基因及其基因本体(GO)功能。
研究团队运用多启动子分析技术,锁定AT-Hook、同源异型域(homeodomain)、MYb/SANT、TBP和WRKY家族的上调关键TFs,以及Dof、碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)、碱性亮氨酸拉链(bZIP)和锌指同源域(ZF-HD)等下调TFs。Venny v2.1工具揭示:上调基因主要参与脂肪酸代谢和光合作用等生物过程(BP),其分子功能(MF)集中于转移酶活性;而下调基因多响应非生物胁迫,具有调控因子和抑制酶特性。
这些发现不仅阐明了大豆抗旱的分子机制,更为分子设计育种提供了理论依据——通过精准调控这些关键TFs,可优化作物在干旱条件下的基因表达模式,为培育抗旱新品种开辟了新途径。
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