综述：非洲西尼罗河病毒全球公共卫生应对中的基因组监测缺口：系统性综述

这篇综述系统评估了非洲西尼罗河病毒（WNV）的分子监测现状，揭示了该地区基因组数据匮乏（仅63条全基因组序列）、检测能力不均衡及传播动态认知不足等问题。作者提出通过一体化健康（One Health）监测策略填补空白，强调低成本诊断工具和靶向基因组测序对防控这一WHO优先病原体的重要性。

　　

非洲西尼罗河病毒的监测困境与全球传播

摘要
西尼罗河病毒（WNV）作为优先病原体，在非洲呈现长期地方性流行却面临严重的基因组监测缺口。本文通过系统分析79项分子研究，揭示非洲仅16个国家贡献了63条全基因组序列，39国存在病毒循环但分子数据零散。研究提出通过一体化健康监测解决诊断不足、数据碎片化等核心挑战。

引言
WNV通过鸟-蚊循环传播，可感染人类与马匹等终末宿主。尽管1937年首次在乌干达分离，非洲作为病毒起源地的分子流行病学研究却远落后于欧美。神经侵袭性疾病致死率达10-30%，而80%感染无症状的特点加剧了监测难度。

分子监测以科研驱动为主
非洲WNV研究呈现明显地域差异：

• 南非、塞内加尔和突尼斯贡献了70%的分子研究
• 人类检测阳性率差异显著：突尼斯爆发期间达50%，南非地方性流行区仅0.9%
• 马匹哨兵监测仅在南非和摩洛哥开展，鸟类监测覆盖10国35个物种

未被发现的传播热点
地理分析显示127个行政区域存在病毒循环但缺乏分子监测，包括：

• 埃塞俄比亚阿法尔州（鸟类多样性热点）
• 埃及尼罗河谷（最小感染率23.00的库蚊分布区）
• 纳米比亚（2020年检出与南非1958年同源的L2谱系）

基因组多样性图谱
非洲存在L1A、L2、L7-L8和Koutango病毒谱系：

• L1A：推测1931年从塞内加尔扩散至埃及，2012-2018年持续向欧洲输出
• L2：南非为主要起源地，1958年株与刚果、纳米比亚毒株形成独立进化枝
• 马达加斯加1978年分离株呈现独特遗传特征

三大行动建议

1. 诊断革新：评估快速抗原/IgM检测在资源受限地区的适用性，结合病毒中和试验确认
2. 哨兵监测：优先发展马匹神经疾病监测网络，覆盖鸟类迁徙路线关键节点
3. 数据共享：利用非洲CDC新建的测序网络，建立跨物种基因组数据库

未解之谜与未来方向

• 蜱类在长距离传播中的作用尚待验证
• 西非国家虽无报告病例，但生态模型预测存在传播风险
• 需协调非洲与欧洲的候鸟携带病毒监测项目

该研究为理解WNV的非洲起源与全球扩散提供了关键证据，凸显加强监测对预防国际公共卫生事件的重要性。