基于计算指导的嘧啶-噁唑杂合体设计与合成:新型抗糖尿病药物的动力学与分子互作研究

【字体: 时间:2025年07月28日 来源:Computational Biology and Chemistry 2.6

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  本研究针对糖尿病治疗中α-淀粉酶和α-葡萄糖苷酶抑制剂的开发瓶颈,通过计算辅助设计合成10种嘧啶-噁唑杂合体。其中化合物8对α-淀粉酶(IC50=5.20±0.10 μM)和α-葡萄糖苷酶(IC50=5.70±0.10 μM)的抑制活性显著优于标准药物阿卡波糖,ADMET分析显示其无毒性,为新型抗糖尿病药物研发提供了候选分子。

  

糖尿病作为全球性健康危机,预计到2045年将影响7.83亿人,其并发症包括心血管疾病、神经病变和阿尔茨海默病等。当前临床使用的α-葡萄糖苷酶抑制剂(α-GIs)存在疗效局限,迫切需要开发新型抑制剂。针对这一挑战,研究人员通过计算辅助药物设计策略,开发了一系列具有嘧啶-噁唑杂合结构的化合物,为糖尿病治疗提供了新思路。

研究采用多学科交叉方法:1) 以4-氯-6-甲基嘧啶-2-胺为起始原料的有机合成技术;2) 核磁共振(1H-NMR/13C-NMR)和高分辨质谱(HREI-MS)结构确证;3) 酶抑制活性测定(IC50);4) 分子对接和分子动力学(MD)模拟;5) 密度泛函理论(DFT)计算;6) ADMET(吸收、分布、代谢、排泄和毒性)预测分析。

【结果与讨论 2.1 化学合成】
通过多步反应成功构建嘧啶-噁唑杂合骨架,关键中间体经亲核取代和环化反应获得目标化合物1-10。核磁共振氢谱显示噁唑环特征质子峰在δ 7.8-8.2 ppm,质谱数据与理论分子量吻合。

【生物学评价】
化合物8表现出最优抑制活性,对α-淀粉酶和α-葡萄糖苷酶的IC50值分别为5.20±0.10 μM和5.70±0.10 μM,较阿卡波糖(10.50±0.20 μM/10.80±0.10 μM)提高约2倍。构效关系分析表明,苯环对位甲氧基取代可增强与酶活性位点的疏水相互作用。

【分子模拟研究】
分子对接显示化合物8通过氢键与α-葡萄糖苷酶的Asp352和Glu277结合,π-π堆积与His280作用。MD模拟证实复合物在100 ns内保持稳定,均方根偏差(RMSD)<2 ?。DFT计算揭示HOMO电子密度集中在噁唑环,利于酶活性位点电子转移。

【结论】
该研究通过"设计-合成-评价"一体化策略,发现化合物8作为双重α-淀粉酶/α-葡萄糖苷酶抑制剂,其优势在于:1) 显著提高的酶抑制活性;2) 计算预测的良好药代动力学特性;3) 无毒性警示的结构特征。这项工作不仅为糖尿病治疗提供了先导化合物,更展示了计算生物学在药物研发中的指导价值,相关成果发表在《Computational Biology and Chemistry》。特别值得注意的是,研究中采用的MD模拟和DFT计算为理解抑制剂-酶相互作用提供了动态视角,这种多尺度研究方法将成为未来抗糖尿病药物开发的重要范式。

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