新型细胞色素bd氧化酶抑制剂发现:抗结核分枝杆菌药物研发新突破

【字体: 时间:2025年07月28日 来源:European Journal of Medicinal Chemistry 6.0

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  为解决耐药结核病治疗难题,研究人员通过计算与实验相结合的策略,发现靶向细胞色素bd氧化酶(Cyt-bd)的新型抑制剂TB25系列,其与Cyt-bcc抑制剂Q203联用可产生协同杀菌效应,为双靶点抗结核治疗提供新思路。

  

结核病至今仍是全球传染病死亡的主因之一,尽管已有异烟肼(INH)、利福平(RIF)等一线药物,但耐药结核病(DR-TB)和长达半年的治疗周期仍是重大挑战。结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)依赖电子传递链(ETC)中的细胞色素bd氧化酶(Cyt-bd)和细胞色素bcc氧化酶(Cyt-bcc)维持能量代谢,当Cyt-bcc被Q203等抑制剂阻断时,Cyt-bd会代偿性激活——这种"逃生机制"导致现有疗法效果有限。更棘手的是,Cyt-bd抑制剂目前仅有醌类化合物如Aurachin D,但因其与哺乳动物线粒体底物结构相似而存在毒性风险。

华东师范大学(中国)和NYU-ECNU计算化学联合中心的研究团队在《European Journal of Medicinal Chemistry》发表研究,通过整合计算与实验方法,开发出新型Cyt-bd抑制剂。他们采用配体/结构双虚拟筛选(LBVS/SBVS)技术,从ChemDiv等六大化合物库中初筛候选分子,经分子对接、分子动力学(MD)模拟和结合自由能计算优化后,最终通过巨噬细胞感染模型验证活性。

材料与方法
研究建立多层级筛选体系:先以已知抑制剂为模板进行LBVS相似性搜索,再通过SBVS对接Cyt-bd晶体结构(PDB 7NKZ),采用Amber18软件进行100ns MD模拟评估复合物稳定性,最终用微稀释法测定最小抑菌浓度(MIC50)。

主要发现

  1. 从虚拟筛选中获得的TB25、TB25-2和TB25-14在巨噬细胞模型中展现出>94%的结核菌杀灭率
  2. 与Cyt-bcc抑制剂Q203联用时产生显著协同效应,证实双靶点抑制策略的可行性
  3. 新化合物结构与醌类差异显著,通过PyMOL可视化显示其结合于Cyt-bd的疏水口袋,避免了与哺乳体酶系的交叉反应

结论与意义
该研究首次系统验证了Cyt-bd/Cyt-bcc双靶点抑制在抗结核治疗中的价值。不同于传统醌类抑制剂,TB25系列通过全新骨架规避毒性问题,其与Q203的协同效应为缩短疗程提供可能。这项工作不仅建立了从计算预测到实验验证的高效筛选流程,更为耐药结核和潜伏感染的治疗开辟了新途径。研究团队特别指出,下一步将优化化合物的药代动力学特性,推动其向临床转化。

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