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水稻PERK基因家族响应盐胁迫的全基因组鉴定及RNA编辑位点预测研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月29日 来源:Genetic Resources and Crop Evolution 1.6
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本研究针对禾本科作物中富含脯氨酸受体激酶(PERK)家族功能未知的问题,来自未知机构的研究团队通过生物信息学手段系统鉴定了水稻8个非冗余OsPERK基因,揭示其通过片段和串联复制扩张的进化特征,发现12种RNA编辑事件及盐胁迫下OsPERK1/2/5/8的显著上调,为作物抗逆育种提供了新靶点。
在植物应对环境胁迫的精密调控网络中,富含脯氨酸的受体激酶(PERK)如同分子开关般调控着关键代谢通路。科研人员对水稻(Oryza sativa)基因组展开地毯式搜索,揪出了8个散落在不同染色体上的PERK基因"特工"。这些基因在进化长河中玩起了"变形记"——通过片段复制和串联复制扩张家族规模,同时甩掉冗余的内含子包袱,最终分化成5个特征鲜明的进化枝系。
除了标志性的PERK结构域这个"家族徽章",研究者还发现了4个亚群特异性保守域和10个功能各异的基序模块。更有趣的是,在叶绿体和线粒体基因中捕捉到12种RNA编辑(RNA editing)的分子"变装秀",包括碱基转换的全部可能性。当给水稻"喂盐"时,OsPERK1、2、5、8四个成员立即进入"战斗状态",转录水平显著飙升,暗示它们可能是植物抗盐通路的守门人。这些发现如同拼图般,逐步揭示PERK家族在作物抗逆育种中的潜在价值。
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