基于RNA加工相关基因的肝细胞癌分子分型揭示预后特征与免疫微环境异质性

来自多中心的研究团队通过整合单细胞测序和转录组数据，系统分析了RNA加工相关基因(RPRGs)在肝细胞癌(HCC)中的分子特征。研究鉴定出8个关键预后基因(LGALS3、THOC2等)，构建了具有临床预测价值的风险模型，并揭示了不同风险组间免疫微环境(Treg细胞与抗肿瘤免疫细胞)的显著差异，为HCC精准治疗提供了新靶点。

　　

这项生物信息学研究深入探索了RNA加工相关基因(RPRGs)在肝细胞癌(HCC)中的分子机制。科研人员从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)获取HCC单细胞及转录组数据，结合分子特征数据库(MSigDB)中的RPRGs信息，通过AUcell评分系统成功将HCC划分为两种具有显著差异的分子亚型。

研究团队运用回归分析筛选出8个关键预后基因：LGALS3、THOC2、TYW3、SFPQ、GTPBP4、SMAD2、DTWD1和ZC3H13，这些基因在高风险组(HR)和低风险组(LR)中呈现差异化表达模式。基于这些标志物构建的预测模型在训练集和验证集中均表现出优异的稳定性。

单样本基因集富集分析(ssGSEA)揭示了有趣的免疫特征：预后较差的HR组富含具有免疫抑制功能的调节性T细胞(Treg)，而预后较好的LR组则显著富集抗肿瘤免疫细胞。研究还通过药物敏感性分析鉴定了针对不同风险组的潜在治疗策略。

该成果不仅阐明了RPRGs在HCC分子分型中的关键作用，更为重要的是揭示了这些基因通过调控免疫微环境影响患者预后的新机制，为开发个体化治疗方案提供了理论依据。