马拉维5岁以下儿童胃肠炎诺如病毒基因组特征分析(2012-2024)

来自马拉维的研究团队针对诺如病毒(NoV)基因组数据缺乏的问题，通过对2012-2024年5岁以下胃肠炎(GE)患儿粪便样本进行高通量测序，成功获得5株GII型诺如病毒全基因组序列，为非洲地区诺如病毒分子流行病学研究提供了重要数据。

　　

这项突破性研究揭示了非洲马拉维地区诺如病毒(NoV)的基因组奥秘。作为引起胃肠炎(GE)的"头号嫌疑犯"，这种单链RNA病毒虽然仅有7.5kb的基因组，却包含三个关键开放阅读框(ORF)，分别编码多蛋白(~5,100bp)、VP1(~1,600bp)和VP2(~720bp)。研究人员采用Illumina NextSeq 2000测序平台，从2012-2024年间收治的5岁以下GE患儿粪便样本中，成功捕获5株GII型诺如病毒全基因组。

实验团队运用了前沿的分子生物学"组合拳"：QIAamp RNA提取试剂盒确保核酸质量，全转录组扩增(WTA)技术解决RNA病毒检测难题，Bowtie2和iVar等生物信息学工具完成基因组组装。特别值得注意的是，这些毒株与美国的GII.17(MZ279715.1)和GII.4(JX126912.1)毒株表现出高度同源性，测序深度最高达1115.8×，基因组完整性超过99%。

这项由盖茨基金会资助的研究，不仅填补了非洲地区诺如病毒基因组数据的空白，更为全球食源性腹泻防控提供了重要的分子流行病学依据。5个高质量基因组数据已存入NCBI数据库(登录号PV611445-PV611449)，为后续疫苗研发和疫情预警奠定了坚实基础。