反刍动物肠道共生菌基因组破译：揭示三种Eubacteriales菌株的木质纤维素降解潜能

来自美国能源部联合基因组研究所的研究团队完成了三种反刍动物肠道Eubacteriales模式菌株（Eubacterium ruminantium ATCC 17233T、Eubacterium uniforme ATCC 35992T和Lacrimispora xylanisolvens DSM 3808T）的基因组测序，获得2.8-5.6 Mb不等的草图基因组，鉴定出多个GH10/GH11木聚糖酶基因，为开发新型生物燃料酶制剂提供基因资源。

　　

在反刍动物复杂的消化系统中，一群神秘的微生物正悄然执行着将植物细胞壁转化为能量的重要使命。最新研究揭开了三种关键共生菌的基因组密码：来自奶牛瘤胃的Eubacterium ruminantium ATCC 17233^T（2.8 Mb/2550基因）、南非绵羊瘤胃分离的Eubacterium uniforme ATCC 35992^T（2.9 Mb/2470基因），以及荷兰牛粪中发现的Lacrimispora xylanisolvens DSM 3808^T（5.6 Mb/5360基因）。

这些严格厌氧的革兰氏阳性杆菌均展现出卓越的木聚糖发酵能力。通过Illumina HiSeq平台的高通量测序，研究人员发现每个基因组都携带3个糖苷水解酶（GH10/GH11）基因——这些分子剪刀专门负责切断植物细胞壁中的木聚糖链。有趣的是，基因组比较显示E. uniforme和L. xylanisolvens目前仍是"独行侠"，而6个所谓的E. ruminantium菌株中仅有4个符合ANI≥96.5%的物种界定标准。

这些隐藏在反刍动物消化道的微生物基因宝库，不仅解释了牛群"化草为奶"的奥秘，更蕴含着开发生物燃料的钥匙。特别是那些GH10/GH11木聚糖酶，在工业级纤维素降解中展现出诱人前景。这项由美国能源部支持的研究，首次系统描绘了这三种重要共生菌的基因组图谱，为微生物资源开发利用提供了重要参考。