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Artemis抑制剂在癌症放射增敏治疗中的设计与发现:计算生物学新进展
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月29日 来源:Frontiers in Chemistry 4.2
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本文综述了Artemis蛋白作为非同源末端连接(NHEJ)DNA修复通路关键支架蛋白的抑制作用,通过计算生物学方法筛选出新型小分子抑制剂(如化合物42,ΔG=?36.94 kcal/mol),结合体外实验验证其通过阻断双链断裂(DSB)修复增强癌细胞对电离辐射(IR)敏感性的机制,为开发靶向放射增敏剂提供理论依据。
实验方法学
研究采用Artemis缺陷型(CJ179)、野生型(1BR3)和突变型(48BR)细胞系,通过1 Gy电离辐射诱导微核形成实验,证实Artemis缺失导致DNA修复缺陷。原发性乳腺癌细胞培养显示2PRF和1MOS细胞增殖最活跃(24小时达2.4×106 cells/mL)。siRNA转染使Artemis基因表达降低20%-40%,伴随p53表达上调46%,提示细胞凋亡通路激活。
计算生物学策略
虚拟高通量筛选(vHTS)从69个化合物中锁定16个高结合力候选分子(ΔG8.0 kcal/mol)。化合物42通过AutoDock4和Glide双软件验证,与Artemis催化中心锌离子形成配位键,并与LYS36(52.43%氢键占有率)、HIS319等关键残基稳定结合。密度泛函理论(DFT)计算显示其HOMO-LUMO能隙3.46 eV,分子静电势图揭示亲核攻击位点集中于苯并咪唑环。
动态行为验证
100 ns分子动力学(MD)模拟中,复合物42的RMSD稳定在0.25 nm,MM-GBSA结合自由能达?36.94 kcal/mol。自由能景观(FEL)分析显示其构象能垒低于参考药物头孢曲松(ceftriaxone),而主成分分析(PCA)表明其结合口袋体积压缩至7ABS-42 < 7ABS-ceftriaxone < 7ABS-51,印证了更强的空间适配性。
放射增敏机制
体外实验证实Artemis抑制剂HMAD使癌细胞在0.5 Gy辐射下存活率降低50%,彗星实验显示DNA损伤累积。值得注意的是,抑制Artemis并未显著影响NHEJ核心蛋白DNA-PKcs的表达,但通过激活p53通路诱导细胞周期阻滞。
转化医学价值
该研究首次整合计算预测与功能实验,阐明Artemis抑制剂通过双重机制——破坏DSB修复和激活凋亡通路——实现放射增敏。化合物42的优异药代特性(logP=3.82,TPSA=84.76?2)为其后续临床前开发奠定基础,有望克服肿瘤放射抗性难题。
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