三元分裂pFAST荧光报告系统的设计与评估:活细胞中三元蛋白复合物的可视化新工具

【字体: 时间:2025年07月30日 来源:Nature Communications 14.7

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  研究人员针对活细胞中多蛋白复合物可视化难题,开发了基于pFAST荧光报告系统的三元分裂技术(tripartite-split-pFAST)。通过优化分裂位点(98-99/114-115)和荧光素(HMBR/HBR-2,5DM)结合特性,实现了动态三元蛋白互作的高时空分辨率成像,为研究膜接触位点(MCSs)和转录因子组装等过程提供了新工具。成果发表于《Nature Communications》。

  

在细胞生命活动中,蛋白质往往以复杂的三元甚至多元复合体形式发挥作用,但现有技术如FRET(荧光共振能量转移)和BiFC(双分子荧光互补)仅能监测二元互作。这种局限性严重阻碍了对细胞信号传导、膜接触位点调控等关键过程的理解。如何突破技术瓶颈,实现活细胞内三元蛋白复合物的动态可视化,成为领域内亟待解决的难题。

法国索邦大学(Sorbonne University)Arnaud Gautier团队创新性地将化学遗传荧光报告系统pFAST(fluorescence-activating and absorption-shifting tag)进行三元分裂设计。通过计算预测和实验验证,确定了98-99和114-115两个关键分裂位点,构建出三个互补片段(pFAST1-98、pFAST99-114和pFAST115-125)。当这些片段通过靶蛋白的互作被拉近时,可快速可逆地结合荧光素HBR-2,5DM形成荧光四元复合体,其结合解离常数(KD)达1.2±0.1μM,动态范围提升100倍。该成果发表于《Nature Communications》,为研究高阶蛋白组装提供了突破性工具。

研究采用四大关键技术:1)基于CPred算法的分裂位点预测;2)正交蛋白工程改造RspAFAST片段降低背景信号;3)流式细胞术定量互补效率(EC50参数分析);4)共聚焦显微镜实时追踪膜接触位点的荧光信号动态。

功能位点筛选与验证
通过比较七种环状排列变体(cpFAST),发现98-99位点分裂的RspAFAST片段与FRB/FKBP系统联用时,在雷帕霉素诱导下EC50,+interaction降至3.0±0.3μM,而自发互补背景(EC50,-interaction)高达270μM。

三元系统构建
将pFAST分裂为三个片段后,采用HBR-2,5DM荧光素时互补效率显著提升。在FRB-FKBP化学诱导三聚化(CIT)模型中,荧光信号10分钟内增强10倍,半衰期<2分钟。

膜接触位点成像
在HeLa细胞中成功监测到线粒体-内质网-质膜三器官接触位点的形成:


图像相关系数分析显示,雷帕霉素处理后信号共定位显著增强(P<0.0001)。

Fos-Jun-DNA复合体检测
通过将片段分别融合bZIP结构域和组蛋白H2B,在细胞核内特异性检测到AP-1转录因子与DNA的相互作用,而缺失突变体bFosΔ(179-193)则完全丧失信号。

该研究开创性地将化学遗传报告系统拓展至三元互作检测领域,其快速可逆的特性克服了传统BiFC技术的时间分辨率限制。通过精确控制片段互补的能量阈值,实现了背景信号的最小化(<6.5%)和诱导信号的最大化(81%)。特别在膜接触位点研究中,技术首次证实了三器官连接结构的存在,为细胞器互作网络研究提供了全新视角。Sara Bottone等开发的技术平台,未来可广泛应用于转录调控、信号转导和细胞器动态等领域的高阶蛋白复合体研究。

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