靶向TACE的肉桂啉衍生物:通过计算与实验方法探索其在乳腺癌治疗中的潜力

【字体: 时间:2025年07月30日 来源:Essential Chem

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  这篇研究通过计算模拟和实验验证,揭示了3-乙酰基-6-(取代苯甲酰基)肉桂啉-4(1H)-酮衍生物(C10)作为新型TACE(ADAM17)抑制剂的潜力。研究结合分子对接(-11.4 kcal/mol结合能)、100 ns分子动力学模拟(RMSD<1.5?)和MTT实验(IC50=41.3 μg/mL),证实该化合物通过阻断EGFR信号通路抑制MCF-7乳腺癌细胞增殖。ADMET预测显示其符合Lipinski五规则(LogP=1.50-3.61),且密度泛函理论(DFT)计算揭示2.09 eV的HOMO-LUMO能隙赋予其良好反应活性,为开发靶向乳腺癌的TACE抑制剂提供了新思路。

  

分子靶标预测与网络分析
研究通过Venn分析发现102个肉桂啉衍生物靶点与18,389个癌症靶点存在96个交叉靶标,其中TACE(ADAM17)作为核心靶点占比26.7%。基因网络显示TACE与EGFR、PIK3CA、mTOR等关键致癌蛋白形成交互网络,通过剪切膜结合型TNF-α(EC50=0.1 nM)激活下游炎症和转移通路。Ramachandran图验证靶蛋白3WEJ的立体结构合理性(88.5%残基位于优势区)。

计算模拟与结合机制
分子对接显示4-硝基取代衍生物C10与TACE活性位点形成3.04-3.22?氢键(His405/Val440/Asn442),结合能达-11.4 kcal/mol。100 ns分子动力学模拟证实复合物稳定性(Cα-RMSD=1.5?),关键残基His405保持55%氢键占有率。密度泛函理论计算显示C10的HOMO(-8.66 eV)电子密度集中于肉桂啉环,而LUMO(-6.57 eV)定位于硝基苯甲酰基,2.09 eV能隙表明其适宜的药物活性。

合成与表征
通过四步反应合成C10:4-氯苯胺经重氮化后与乙酰乙酸乙酯缩合(收率82%),AlCl3催化环化(收率76%),最后与4-硝基苯甲醛缩合(收率79%)。FTIR证实C=O伸缩振动(1718 cm-1)和NO2特征峰(1548/1356 cm-1);1H-NMR显示芳香质子多重峰(δ 6.87-7.91 ppm)和乙酰基单峰(δ 2.59 ppm)。

药理活性评估
MTT实验显示C10对MCF-7细胞呈剂量依赖性抑制(100 μg/mL时存活率33.8%),IC50为41.3 μg/mL。SwissADME预测其具备良好口服生物利用度(TPSA=125.71 ?2),但存在CYP2C9/2C19抑制风险(PAINS警报2处)。与临床TACE抑制剂TAPI-1相比,C10显示出更优的选择性(对MMP-2/9抑制活性<10%)。

转化医学意义
该研究首次阐明肉桂啉骨架通过双重机制发挥作用:直接抑制TACE酶活性(Ki=0.8 μM)和阻断EGFR反式激活。分子模拟揭示C10的4-硝基与TACE锌离子结合域(Zn2+-NO2距离2.1?)产生特异性相互作用,这为开发克服耐药性的新一代乳腺癌靶向药物提供了结构优化方向。

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