韩国首尔窗杀白颊鹎（Pycnonotus sinensis）线粒体全基因组测序与系统发育分析揭示东亚种群扩张机制

这篇研究通过新一代测序技术（NGS）对韩国首尔窗杀死亡的5只白颊鹎（Pycnonotus sinensis）进行线粒体全基因组测序（16,923bp含13个PCGs、22 tRNAs、2 rRNAs），揭示其与中国海南亚种（P. s. hainanus）形成单系群（遗传相似度99.62-99.69%），为理解该物种在东亚的快速扩张（2000年代起）及城市化适应提供了关键分子证据，同时警示建筑窗杀对城市鸟类的威胁。

　　

Abstract

白颊鹎（Pycnonotus sinensis）作为东亚快速扩张的鸟类物种，其韩国种群的遗传背景长期缺乏研究。本研究通过高通量测序技术首次获得5例首尔窗杀个体的完整线粒体基因组（16,923bp），填补了该物种在朝鲜半岛的分子数据空白。

Introduction

这种原生于中国南方的雀形目鸟类，自1930年代起持续北扩，2004年首次在韩国椒岛记录繁殖。近年其在首尔等大都市的出现，被认为与全球变暖（韩国百年升温1.7°C）及城市人工栖息地增加相关。线粒体基因组作为鸟类系统发育研究的金标准，可有效追踪种群扩散路径。

Materials and methods

2023年10月于建国大学校园（37.5434°N, 127.0776°E）收集窗杀个体，经形态学鉴定后取肌肉组织提取DNA。采用多重PCR扩增结合Illumina MiniSeq平台测序，通过SPAdes和Minimap2进行^{de novo}与参考基因组（NC_013838）双重组装，MITOS2注释显示典型鸟类线粒体结构：13个氧化磷酸化相关基因、22个tRNA及2个rRNA。

Results

五例样本显示高度一致性（99.65-99.77%），与海南亚种（KJ147475）聚为高支持度单系群（bootstrap=98%），而与台湾亚种（GU475148）存在0.54-0.60%遗传距离。核苷酸组成偏向AT富集（A+T=53.9%），符合鸟类线粒体特征。

Discussion and conclusion

分子证据支持韩国种群源自中国南方，其城市化扩张受三重驱动：

1. 气候因素：韩国1997-2014年升温1.2°C，使亚热带物种北迁成为可能；
2. 生态可塑性：该物种能利用城市食物资源、改变筑巢策略，繁殖成功率随城市化提升；
3. 人为威胁：韩国年均788万鸟类窗杀死亡，需推广防撞玻璃等鸟友好建筑。

研究局限在于仅分析线粒体基因组，未来需结合核基因组（如SNPs）揭示更精细的适应机制。这些"城市入侵者"的基因组档案，为理解生物地理变迁与人类世生态响应提供了独特案例。