
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
基于生物信息学筛选与验证COPD-OSA重叠综合征核心基因GRM8的分子机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月30日 来源:International Journal of Chronic Obstructive Pulmonary Disease 2.7
编辑推荐:
本研究通过生物信息学方法首次系统分析了慢性阻塞性肺疾病(COPD)与阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)重叠综合征(OS)的共同分子机制。研究团队整合GEO数据库的基因表达数据,运用差异表达分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA)技术,鉴定出5个关键基因(MYH11/BCHE/SOSTDC1/GRM8/OGN),并通过外部数据集验证和RT-qPCR实验证实代谢型谷氨酸受体8(GRM8)在OS患者中显著下调(P<0.05),其ROC曲线下面积(AUC)达0.857。该发现为OS的早期诊断和靶向治疗提供了新思路。
背景
慢性阻塞性肺疾病(COPD)与阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)作为两种高发呼吸系统疾病,当共存于同一患者时被称为重叠综合征(OS)。流行病学研究显示,OS患者全因死亡率显著高于单一疾病患者。尽管两者在临床表现上存在交互作用,但其共同分子机制尚未阐明。
材料与方法
研究团队从GEO数据库获取OSA(GSE135917)和COPD(GSE38974)基因表达数据集,通过差异表达分析筛选出9个共同差异表达基因(DEGs)。采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定出128个关键模块基因,功能富集分析显示这些基因显著富集于趋化因子信号通路(chemokine signaling pathway)和病毒蛋白-细胞因子互作通路。通过交集分析最终锁定5个核心基因(MYH11/BCHE/SOSTDC1/GRM8/OGN)。
结果
在外部验证集(GSE106986)中,代谢型谷氨酸受体8(GRM8)表现出显著诊断价值:COPD组表达量较对照组显著下调(P=0.019),ROC曲线AUC达0.857(95% CI: 0.614-1.000)。临床样本RT-qPCR验证显示,OS组GRM8表达量较健康对照组降低超50%(P<0.05)。值得注意的是,GRM8基因多态性已被既往研究证实与尼古丁依赖和摄食行为调控相关。
讨论
GRM8作为G蛋白偶联受体,其下调可能通过双重机制促进OS发生:一方面通过增强尼古丁依赖性加重COPD风险,另一方面通过下丘脑通路调控摄食行为导致肥胖相关OSA。动物实验表明,GRM8缺陷会加剧谷氨酸兴奋毒性,这可能是OS患者认知功能障碍加重的原因。功能富集分析提示,趋化因子通路可能是两疾病共有的关键炎症调控节点。
结论
该研究首次通过生物信息学结合实验验证揭示GRM8作为OS的核心调控基因,其表达水平与疾病严重程度显著相关。这一发现不仅为OS的早期筛查提供了潜在分子标志物,也为开发靶向谷氨酸受体的新型治疗策略奠定了理论基础。未来研究需扩大样本量并深入探索GRM8在OS中的具体调控机制。
生物通微信公众号
知名企业招聘