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首例高选择性1,4-二氢吡啶并[3,4-b]吡嗪-3(2H)-酮类MKK4抑制剂的发现及其在肝再生治疗中的突破性应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月31日 来源:Journal of Medical Mycology 2.2
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研究人员针对肝衰竭治疗选择有限的重大医学挑战,通过靶向丝裂原活化蛋白激酶激酶4(MKK4)开发新型小分子抑制剂。基于非选择性RSK抑制剂BI-D1870的结构优化,成功设计出高选择性1,4-二氢吡啶并[3,4-b]吡嗪-3(2H)-酮类化合物39和45,其MKK4抑制活性达纳摩尔级(IC50分别为78 nM和22 nM),且显著降低对RSK4等脱靶激酶的活性。该研究为肝再生治疗提供了全新药物设计策略,相关成果发表于《Journal of Medical Mycology》。
肝脏疾病是全球健康重大威胁,每年导致超200万人死亡,其中非酒精性脂肪肝病(NAFLD)因缺乏有效疗法而发病率持续攀升。2013年,科学家通过全基因组RNAi筛选发现丝裂原活化蛋白激酶激酶4(Mitogen-activated protein kinase kinase 4, MKK4)是肝细胞再生的关键调控因子——其基因沉默可减少纤维化、加速细胞周期进程并增强抗凋亡能力,这使其成为治疗退行性肝病的理想靶点。然而现有MKK4抑制剂普遍存在选择性差、毒性大等问题,开发高选择性抑制剂成为当务之急。
德国蒂宾根大学(Eberhard Karls University Tübingen)药物化学系的Leon Katzengruber团队通过"脱靶转靶向"策略,将非选择性激酶抑制剂BI-D1870改造为高选择性MKK4抑制剂。研究人员采用计算机辅助的同源建模确定结合模式,通过系统性结构修饰(包括二氢蝶啶酮核心改造、N-8烷基链优化及酚羟基pKa调控),最终获得化合物39和45。这两种化合物不仅对MKK4表现出纳摩尔级抑制活性(IC50分别为78 nM和22 nM),且对RSK4的选择性分别提高37倍和48倍。激酶谱分析显示化合物39在1 μM浓度下仅抑制3种激酶,显著优于母体化合物BI-D1870(抑制20种激酶)。细胞实验证实其毒性显著降低(TD50>30 μM),并通过细胞热转移分析(Cellular Thermal Shift Assay, CETSA)验证了靶标结合特异性。
研究主要采用五大关键技术:1)基于33P的放射测定法(PanQinase assay)评估激酶抑制活性;2)350种野生型激酶的谱系筛选;3)小鼠肝微粒体代谢稳定性测试;4)热迁移实验(Thermal Shift Assay)验证靶标结合;5)NrasG12V;Cdkn2aARF-/-肝癌细胞系的细胞毒性评估。
结果与讨论
初始SAR:二氟酚基团的改造
通过系统修饰BI-D1870的二氟酚基团,发现酚羟基的酸性(pKa≈7)对MKK4结合至关重要。四氟类似物16活性最佳(IC50=73 nM),而移除氟原子(14)或酚羟基(13)导致活性丧失,提示其结合模式与RSK2相似。
铰链结合基序的鉴定
通过对比化合物18(IC50=390 nM)和19(IC50>100 μM)的活性,证实吡啶N-3是关键的铰链结合位点,这一发现为后续设计提供方向。
核心结构优化
去除C-7甲基(20)使活性提高7倍(IC50=53 nM),而N-5乙基化(21)则显著降低活性,表明MKK4结合腔对该区域体积敏感。将酰胺羰基还原为亚甲基(22)导致活性丧失,提示其与Lys187可能存在氢键相互作用。
N-8脂链改造
环己基类似物23(IC50=45 nM)表现出最佳活性,而环丙基衍生物28(IC50=99 nM)具有更高选择性(RSK4/MKK4=4)。研究还发现体积增大虽提高RSK4活性但降低MKK4抑制,这种反向相关性为选择性设计提供依据。
酚基团pKa与体积调控
引入氰基(39)和氯原子(45)分别获得37倍和48倍的选择性提升。特别值得注意的是,3-氟-2-羟基苯甲腈衍生物39对NLK和PLK2的脱靶抑制较弱(IC50>977 nM),远优于母体化合物。
结论与意义
该研究首次报道了1,4-二氢吡啶并[3,4-b]吡嗪-3(2H)-酮类高选择性MKK4抑制剂,通过多参数优化解决了激酶抑制剂选择性差的共性难题。化合物39和45不仅具有优异的体外特性(代谢稳定性>120分钟),其独特的选择性特征(激酶谱评分0.009)更为肝再生治疗提供了安全候选药物。相较于已进入临床试验的HRX-215(Darizmetinib),该化学型展现出互补优势:通过非共价结合避免潜在毒性,且结构更易于进一步优化。这项工作不仅验证了MKK4作为肝病治疗靶点的可行性,也为开发其他MAPK通路抑制剂提供了范式。
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