第二代SARS-CoV-2 3CL蛋白酶抑制剂S-892216的发现:一种高效抗新冠病毒候选药物的研发突破

【字体: 时间:2025年07月31日 来源:Journal of Medical Mycology 2.2

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  为解决COVID-19治疗中第一代3CLpro抑制剂(如nirmatrelvir)需联用药代动力学增强剂、部分变异株耐药性增强等问题,Shionogi团队通过结构优化设计出新型可逆共价抑制剂S-892216。该化合物对SARS-CoV-2及其变异株展现2.48 nM的EC50值,动物实验中疗效较ensitrelvir提升30倍,且无需药代增强剂。这一突破为应对持续变异的冠状病毒提供了更优治疗方案。

  

新冠病毒大流行虽因疫苗和第一代药物的问世得到缓解,但病毒持续变异导致的免疫逃逸、重复感染及长期后遗症(如慢性疲劳综合征)仍是重大公共卫生挑战。尤其对于高风险患者,现有疗法存在明显局限:首个3CL蛋白酶抑制剂nirmatrelvir需联用ritonavir增强药效,而部分变异株已对ensitrelvir等药物产生耐药性。更棘手的是,传统肽类抑制剂因膜渗透性差、代谢不稳定等问题,难以实现理想的口服生物利用度。

为突破这些瓶颈,日本盐野义制药(Shionogi & Co., Ltd.)的研究团队基于其开发的非肽类非共价抑制剂ensitrelvir(S-217622)的成功经验,通过结构导向设计,发现第二代候选药物S-892216。这项突破性成果发表于《Journal of Medical Mycology》,为COVID-19治疗提供了更优解。

研究团队采用三大关键技术:1)基于X射线晶体学的结构优化(分辨率达1.8-2.3 ?),揭示氰甲基弹头与催化残基C145的可逆共价结合机制;2)建立包含VeroE6/TMPRSS2细胞、人呼吸道上皮细胞(hAECs)的多平台抗病毒评价体系,覆盖22种变异株;3)通过同位素标记(14C)结合SPA技术测定药物-靶标解离动力学(koff(obs)=4.06×10–5 s–1)。

结果与讨论
结构优化突破
从先导化合物1(IC50=143 nM)出发,通过将三嗪二酮核心改造为嘧啶二酮并引入氰甲基弹头,活性提升180倍(化合物4,IC50=0.76 nM)。晶体结构(PDB:9LVV)显示其独特的6,6-二氟-2-氮杂螺[3.3]庚烷占据S1'口袋,诱导M49构象变化形成疏水相互作用。

广谱抗病毒活性
在hAECs中,S-892216对Omicron BA.1/BA.5-like和XBB.1.5.19的EC90达2.31-2.41 nM,且对E166V/M49L耐药突变株保持活性(FC<3.66)。值得注意的是,在小鼠感染模型中,1 mg/kg剂量即可达到ensitrelvir 32 mg/kg的病毒抑制效果。

优异药代特性
大鼠口服生物利用度达100%,犬半衰期24.9小时,且在人肝微粒体中稳定性达96.3%(30分钟)。相比ensitrelvir,其渗透性(LLC-PK1 Papp=6.17×10–6 cm/s)提升近5倍。

这项研究不仅提供了迄今最强的非肽类3CLpro抑制剂(对催化三联体C145-H41的靶向效率提升200倍),更通过独特的螺环胺结构实现代谢稳定性与活性的平衡。其临床优势体现在三方面:1)单药治疗无需联用PK增强剂;2)对现有耐药突变株保持高效;3)30倍剂量优势可降低药物相互作用风险。随着JN.1等新变异株的流行,S-892216的研发为终结COVID-19的反复流行提供了关键武器。

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