全外显子测序揭示复发性造釉细胞型颅咽管瘤的突变特征及关键基因机制

【字体: 时间:2025年07月31日 来源:Journal of Neuro-Oncology 3.1

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  本研究通过全外显子测序(WES)技术,系统解析了造釉细胞型颅咽管瘤(ACP)的基因组变异特征,首次鉴定出PLOD3、COL17A1、FN1和LAMB3四个与肿瘤复发密切相关的关键突变基因。研究人员通过免疫组化(IHC)和免疫荧光(IF)验证发现,这些基因在复发病例的角质结节结构中表达显著升高,为理解ACP复发机制提供了新视角。该成果发表于《Journal of Neuro-Oncology》,为开发靶向干预策略奠定了分子基础。

  

造釉细胞型颅咽管瘤(ACP)是一种看似"温和"却暗藏杀机的颅内肿瘤。虽然被归类为良性,但其特殊的解剖位置——蝶鞍区及鞍上区,使得手术如同在神经血管密布的"雷区"排雷。更棘手的是,即便成功切除,仍有11.1%-25%的患者面临复发风险,反复手术不仅严重影响生活质量,甚至可能导致死亡。传统观点认为CTNNB1基因突变驱动的Wnt/β-catenin信号通路激活是ACP的主要致病机制,但针对该通路的治疗尝试屡屡受挫,这提示我们:ACP的复发可能另有隐情。

中国医学科学院北京协和医学院药物研究所药理教研室与首都医科大学三博脑科医院神经外科的研究团队联手攻关,通过对17例临床样本(包括5对原发-复发ACP)进行全外显子测序,绘制了ACP的突变图谱。研究发现复发病例具有更高的肿瘤突变负荷(TMB),并通过生物信息学筛选出4个特征性体细胞单核苷酸变异(SNV):胶原修饰酶PLOD3、基底膜成分COL17A1和LAMB3,以及细胞外基质蛋白FN1。免疫验证显示这些蛋白在复发肿瘤的角质结节中异常高表达,相关成果发表在《Journal of Neuro-Oncology》上。

研究采用三大关键技术:1) 全外显子测序结合Mutect2/Strelka算法检测体细胞突变;2) STRING数据库构建蛋白互作网络,CytoHubba算法筛选枢纽基因;3) 免疫组化/免疫荧光验证候选基因的蛋白表达定位。样本来自2016-2024年间三博脑科医院手术治疗的ACP患者队列。

【突变谱特征】
测序数据显示复发ACP平均突变数量高于原发组,体细胞SNV主要分布在内含子区(45.45%)和基因间区(25.83%)。特征性C>T/G>A碱基转换提示DNA错配修复缺陷(SBS6特征)和年龄相关突变积累(SBS5特征)。

【复发相关突变】
通过"≥3复发阳性且≤2原发阳性"的严格标准,筛选出84个复发特征基因。PPI网络分析显示这些基因显著富集于细胞外基质降解通路。其中PLOD3 p.R475W、COL17A1 p.G1387V等错义突变被预测为致病性变异。

【临床关联】
生存分析显示,PLOD3等基因突变与泛癌及中枢神经系统肿瘤患者的不良预后显著相关(p<0.05)。KEGG分析揭示COL17A1/FN1/LAMB3共同调控黏着斑和ECM-受体相互作用通路。

【实验验证】
免疫染色显示:COL17A1在复发病例的角质结节中表达强度增加3倍;FN1除结节区域外还在纤维结构中呈现核定位;LAMB3则特异性定位于角质结节,其阳性区域面积与复发呈正相关。

这项研究首次系统描绘了ACP的突变全景图,突破性地发现基底膜成分编码基因(COL17A1/LAMB3)和ECM调控因子(PLOD3/FN1)的突变与复发密切相关。特别值得注意的是,这些突变可能导致类似交界性大疱性表皮松解症(JEB)的细胞-基质黏附缺陷,这为解释ACP特征性角质结节的形成提供了新机制。该发现不仅为ACP复发预测提供了分子标志物,更开辟了靶向细胞外基质重塑的治疗新思路。未来研究需在更大队列中验证这些突变基因的临床价值,并探索其是否可作为免疫治疗响应预测指标(基于高TMB特征)。

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