两栖动物贸易中壶菌(Bd)谱系的基因型鉴别技术开发与应用

为解决国际两栖动物贸易导致的壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis, Bd)谱系扩散问题，研究人员开发了基于TaqMan SNP的基因分型技术，通过qPCR/dPCR成功鉴别Bd-GPL、Bd-ASIA2/Bd-BRAZIL和杂交基因型。该方法在>1000基因组当量样本中准确率达82%，首次在巴西牛蛙养殖场发现共感染现象，为两栖动物保护及贸易监管提供关键技术支撑。

　　

国际两栖动物贸易正成为生态隐患——可能将致命性壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis, Bd)的不同谱系引入新环境。传统定量PCR(qPCR)技术虽能检测Bd存在，却无法区分其基因型。最新研究创新性地采用TaqMan单核苷酸多态性(SNP)分型技术，针对巴西牛蛙养殖场的皮肤拭子、蝌蚪口器及培养样本，建立起能精准鉴别Bd-GPL、Bd-ASIA2/Bd-BRAZIL及杂交株系的检测体系。

研究团队设计了两套检测方案，结合定量PCR(qPCR)和数字PCR(dPCR)技术，不仅解析了Bd载量与基因型判定的关联规律，更在技术层面取得突破：总体分型成功率57%，而当样本基因组当量超过1000时，成功率跃升至82%。尤为关键的是，dPCR技术成功"唤醒"了传统方法无法解析的样本基因信息，使得复杂野外样本的谱系追踪成为可能。培养样本则展现出100%的完美分型效率。

在巴西牛蛙集约化养殖场中，该技术不仅捕获了所有已知本地Bd谱系，更首次揭示出高密度养殖环境下的多谱系共感染现象。这项研究为壶菌的分子流行病学研究提供了利器，无论是纯培养物还是低载量野外样本均适用。研究成果直指两栖动物贸易监管的核心需求，强调必须建立基于基因分型的风险评估体系，为制定科学的养殖场生物安全标准和跨境贸易检疫政策提供了关键技术支撑。