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一种新型热激活单管RPA-CRISPR-Cas12b技术用于肺炎支原体即时检测(TRACER)
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月31日 来源:Biosensors and Bioelectronics 10.7
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为解决肺炎支原体(M. pneumoniae)检测中两步法操作复杂、气溶胶污染风险高的问题,研究人员开发了基于温度调控的单管RPA-CRISPR-Cas12b检测技术(TRACER)。该技术通过精确温控实现重组酶聚合酶扩增(RPA)与CRISPR-Cas12b的顺序激活,检测限达1拷贝/μL,临床验证显示99.2%的灵敏度和100%的特异性,为呼吸道病原体POCT提供了创新解决方案。
肺炎支原体作为呼吸道感染的重要病原体,每年导致20%-40%的儿童呼吸道感染病例。这种微生物引发的临床症状往往缺乏特异性,从普通头痛咳嗽到可能致命的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)都有可能发生。更棘手的是,约12%的住院患儿需要转入重症监护室(ICU)治疗。然而,现有的诊断方法各有限制:金标准的PCR检测需要昂贵设备和专业操作;血清学检测耗时且灵敏度不足;而细菌培养则面临技术复杂、周期长的困境。
针对这一临床痛点,南方医科大学南方医院检验医学科/广东省精密医学诊断重点实验室的研究团队在《Biosensors and Bioelectronics》发表了一项突破性研究。他们巧妙利用重组酶聚合酶扩增(RPA)和CRISPR-Cas12b系统的最适温度差异,开发出名为TRACER(热激活RPA扩增CRISPR-Cas12b高效识别)的创新检测技术。该技术仅需普通智能手机读数和便携式加热装置,就实现了从核酸扩增到信号检测的全流程整合。
研究采用三步关键技术:首先基于嗜热菌Bacillus hisashii来源的BrCas12b构建检测系统,其60°C以上的最适温度与RPA的39°C形成天然屏障;其次设计温度转换程序,先39°C进行25分钟RPA扩增,再升温至66°C激活Cas12b进行15分钟检测;最后采用195例临床样本验证性能,所有操作均在密闭单管内完成。
【初步构建TRACER】部分显示,经过系统优化的F1R4引物对与特异性crRNA组合,成功建立了针对肺炎支原体P1基因的检测体系。温度梯度实验证实,BrCas12b在低于50°C时几乎无活性,而66°C时切割效率达到峰值,这种温度依赖性完美解决了传统单管系统中Cas蛋白过早降解模板的难题。
【结论】部分强调,TRACER技术将检测灵敏度提升至1拷贝/μL,较传统RPA-CRISPR-Cas12a系统提高100倍。临床验证中,对120例阳性样本检出119例,75例阴性样本全部正确识别,总体准确率达99.5%。这种无需物理分隔或光敏crRNA的设计,大幅降低了成本和操作门槛。
该研究的突破性在于:首次利用温度门控原理实现RPA与CRISPR-Cas12b的时空分离,攻克了单管系统中扩增效率与检测灵敏度的矛盾;开发的便携式检测装置仅重500g,配合智能手机读数,真正满足床旁检测需求;每测试成本控制在5美元以内,为资源有限地区的肺炎支原体诊断提供了可行方案。正如作者指出,这种"温度开关"设计理念可拓展至其他病原体检测,为下一代分子诊断技术开发提供了新范式。
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