机器学习辅助微流控器官芯片探索多药联合给药方案优化

【字体: 时间:2025年07月31日 来源:SCIENCE ADVANCES 12.5

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  为解决癌症治疗中多药联合给药方案筛选耗时费力的问题,研究人员开发了集成机器学习(ML)、微流控(MF)和器官芯片技术的闭环平台,成功鉴定了乳腺癌球体和患者来源类器官(PDO)的高效序贯给药方案,在保持疗效的同时显著降低总给药剂量。该研究为个性化化疗方案开发提供了创新工具。

  

癌症治疗的复杂性和肿瘤异质性使得多药联合疗法成为临床标准,但传统方案筛选面临巨大挑战。现有方法难以同时优化药物组合、剂量、时序和疗程等多维参数,且缺乏能模拟体内微环境的临床前模型。更棘手的是,同步给药可能导致毒性叠加,而序贯给药的优化需要探索指数级增长的参数空间。

针对这些难题,研究人员开发了革命性的闭环研究平台。该平台巧妙融合三大核心技术:微流控器官芯片提供生理相关肿瘤模型,自动化系统实现精确时序给药,机器学习算法Gryffin通过贝叶斯优化(BO)高效探索多维参数空间。研究团队首先采用FDA批准的乳腺癌三药组合(5-氟尿嘧啶5-FU、多柔比星DOX和环磷酰胺CPA)验证平台性能,随后拓展至临床研发中的奥拉帕尼(OLA)与IBET-762组合。

关键技术包括:1)构建含1200个微孔的微流控阵列,在仿生水凝胶(EKGel)中培养均一尺寸的MCF-7球体和患者来源类器官;2)开发自动化流体控制系统实现精确时序给药;3)应用Gryffin算法进行多目标优化,以协同指数(CI)和细胞存活率(CVexp)为指标;4)通过活死染色、免疫荧光和流式细胞术多维度验证结果。

研究结果揭示:
"闭环MF平台集成ML"部分证实该平台可在4天内形成300μm标准化PDO,保持89%存活率和增殖活性,Ki-67染色显示与体内相似的生长特征。

"球体有效组合疗法鉴定"显示:对MCF-7球体,三药同步给药的优化方案(G3-7)使CVexp降至65%,CI达-0.12。序贯给药最优方案(GS2-7)实现同等疗效但总剂量降低75%,且DOX先行方案占优。流式显示序贯给药使增殖细胞从83%降至37%。

"PDO有效多药疗法鉴定"发现:OLA与IBET-762同步给药(G3-2)产生显著协同效应(CI=-0.21,CVexp=42%),γH2AX染色证实DNA双链断裂增加。但序贯给药时协同效应消失,CVexp仅降至87%,表明该组合需同步作用。

这项发表于《SCIENCE ADVANCES》的研究具有多重意义:技术层面创建了首个集成ML-MF-PDO的闭环优化平台,可在数周内完成传统方法需数月的筛选工作;临床层面揭示了不同药物组合的最佳给药策略——经典化疗药适合序贯给药降低毒性,而靶向组合则需要同步给药维持协同效应。研究还创新性地证明微流控培养可加速PDO成熟,4天即可获得相当于28天静态培养的模型。未来通过引入免疫微环境、拓展肿瘤类型、结合转移学习等技术,该平台有望成为个性化癌症治疗的标准化工具,并为纳米药物递送方案优化提供新范式。

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