甘蓝型油菜BnaDUF579基因家族的鉴定与表达模式分析

　　

摘要： Domain of unknown function 579 (DUF579)家族广泛存在于真核生物中，该家族在次生细胞壁发育和木聚糖生物合成中发挥着重要的作用。目前，还没有研究系统报道过甘蓝型油菜BnaDUF579基因家族。本研究通过生物信息学方法对甘蓝型油菜BnaDUF579基因家族进行进化树构建、基因结构和保守基序分析、染色体分布和共线性分析、组织表达分析、启动子顺式作用元件分析。结果表明，有31个甘蓝型油菜BnaDUF579家族成员得到鉴定，其中的24个成员都只有一个外显子、没有内含子。这些基因分为4个分支，包括Group1、Group2、Group3和Group4。同一分支内的成员具有相似的基序组成，但不同分支之间的成员在基序组成上存在明显差异。该家族与白菜亲缘关系较远、与甘蓝亲缘关系更近。BnaDUF579基因家族主要在油菜茎、根、角果和种子中表达，其启动子顺式作用元件涉及激素反应、对非生物胁迫的反应、组织发育、光响应。以上研究结果丰富了对甘蓝型油菜BnaDUF579基因的认识，为油菜BnaDUF579基因的功能研究奠定了基础。