纹状棒杆菌72小时内通过ermX质粒快速获得红霉素耐药性的临床演变及分子机制

本研究首次报道了纹状棒杆菌（Corynebacterium striatum）在ICU患者中72小时内通过获得携带ermX基因的质粒（ flanked by ISL3-family转座酶）实现红霉素耐药性（MIC从≤0.25 μg/mL升至4 μg/mL）的临床案例。通过全基因组测序（WGS）和耐药基因数据库（CARD/PIPdb）分析，揭示了ISL3介导的水平基因转移（HGT）机制，建议ICU患者需每日进行药敏试验（AST）并筛查ermX以遏制耐药传播。

　　

Abstract
研究团队在ICU一名合并念珠菌感染的尿路感染患者中，发现其纹状棒杆菌分离株（C1-C4）在72小时内红霉素最小抑菌浓度（MIC）从敏感（≤0.25 μg/mL）骤升至耐药（4 μg/mL）。通过比较基因组学揭示这一现象源于获得携带ermX的10-11 kb质粒，该质粒被ISL3家族转座酶（ISCx1）包围，通过水平转移实现快速传播。

Introduction
曾被视为皮肤共生菌的纹状棒杆菌，近年已成为导致心内膜炎、脑膜炎和医院暴发的多重耐药病原体。本研究首次记录其72小时内获得ermX质粒的临床案例，为ICU耐药防控提供新证据。

Methods
从患者连续7天的尿标本中分离4株菌（C1-C4），采用CLSI M45-A3标准进行微量肉汤稀释法药敏试验。通过Illumina NovaSeq 6000测序（2×150 bp，覆盖度100×），SPAdes v3.15.4组装（N50>100 kb），CARD数据库（严格模式：一致性≥90%，覆盖度≥80%）和ISfinder分析耐药基因及移动元件。

Results
关键发现包括：

1. 表型转变：C1对红霉素敏感（MIC≤0.25 μg/mL），而C2-C4耐药（MIC=4 μg/mL），同时保持对万古霉素（MIC≤0.5 μg/mL）和达托霉素敏感。
2. 基因组证据：仅在耐药株中发现ermX基因（23S rRNA甲基转移酶），其位于含ISL3转座酶的质粒上，与Tn5432转座子结构相似。敏感株仅携带非功能性vanT/vanW基因。
3. 进化分析：27个管家基因系统发育树证实C1-C4为克隆传播，排除外源再感染可能。

Discussion
该研究揭示三个重要现象：

1. 无抗生素选择压力下的快速转移：患者未使用大环内酯类药物，但β-内酰胺类药物可能通过SOS反应促进质粒接合。
2. ICU环境驱动因素：生物膜导管或噬菌体转导可能加速ISL3介导的质粒传播。
3. 临床监测盲区：传统AST间隔可能遗漏超快速耐药事件，需结合每日ermX PCR筛查。

Conclusions
纹状棒杆菌通过获得ermX质粒可在72小时内进化出红霉素耐药性，这种"跳跃式"耐药演变对ICU感染控制提出新挑战。未来需开展多中心研究验证ISL3转座酶的传播动力学，并开发靶向ermX的快速分子检测方法。