法国蛋鸡群沙门氏菌控制计划（2013-2021）：禽舍特征与采样策略对目标血清型检出的影响

这篇研究首次系统分析了法国蛋鸡场沙门氏菌国家控制计划（NCP）9年数据（108,718次采样），揭示笼养系统STS（目标血清型）检出风险比平养/有机系统高60%（OR=1.6），官方采样（CA）阳性率是企业的2.6倍，且夏秋季（Q3 OR=2.8）和东南部地区风险显著升高。研究为优化欧盟（EU）禽类沙门氏菌监测方案提供了关键流行病学证据。

　　

ABSTRACT

沙门氏菌病是欧盟第二大致病性食源性疾病，尽管实施了欧盟统一的蛋鸡群控制计划，鸡蛋仍是重要传播媒介。本研究首次整合法国2013-2021年4744个禽舍的108,718次采样数据，通过混合逻辑回归模型分析STS（含肠炎沙门氏菌S. Enteritidis、鼠伤寒沙门氏菌S. Typhimurium及其单相变种等）检出的关键影响因素。

Introduction

欧盟2023年报告77,486例沙门氏菌病，其中32%暴发与鸡蛋相关。法国自1998年实施NCP，2013年调整以符合欧盟2160/2003法规要求。研究聚焦蛋鸡场——作为人畜共患传播的关键节点，旨在揭示近年发病率平台期的潜在驱动因素。

Methods

数据源自法国农业部动物健康监测平台，覆盖本土64,61个禽舍。最终纳入分析108,718次采样事件，采用考虑禽舍重复采样的混合逻辑回归模型。关键变量包括：禽舍类型（笼养/平养/有机）、采样方（CA/FBO）、样本数、季节和地理区域。

Results

• 检出概况：STS总阳性率0.68%（737/108,718），S. Enteritidis占61%。

• 空间特征：东南部风险最高（OR=3.8），呈现西北-东南梯度（vs西部参照组）。

• 时间规律：Q3（7-9月）风险达峰值（OR=2.8），2020年阳性率0.99%为9年最高。

• 采样策略：CA采样阳性率1.6%（vs FBO 0.51%），样本数≥6时风险激增（OR=5.4）。

• 生产系统：笼养禽舍风险显著高于平养（OR=1.6），可能与高密度饲养相关。

Conclusions

研究建议：1）优化CA风险导向采样策略；2）加强东南部地区监测；3）关注笼养系统生物安全。数据揭示现行NCP在样本量（>5样本显著提高检出）和时空聚焦方面存在改进空间，为欧盟修订控制计划提供实证依据。

关键发现延伸

• 样本类型：粉尘样本阳性率（1.2%）显著高于粪便样本（0.55%），支持环境采样重要性。

• 历史对比：2020-2021年阳性率较2013年翻倍（OR=2.0-2.1），提示流行病学转变。

• 管理启示：禽舍既往阳性史使后续采样风险增加2.4倍，强调彻底消毒的必要性。

注：所有数据均基于法国本土监测数据，海外省未纳入；模型已控制禽舍级别随机效应和变量多重共线性（VIF