坦噶尼喀湖马索科火山口湖同域分布慈鲷生态型(Astatotilapia calliptera)的食性分化:基于宏条形码技术的营养生态位解析

【字体: 时间:2025年07月31日 来源:Environmental DNA 6.2

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  这篇研究通过宏条形码(metabarcoding)技术揭示了坦桑尼亚马索科火山口湖同域分布的慈鲷(Astatotilapia calliptera)沿岸型(littoral)与深水型(benthic)生态型之间的食性分化。研究发现,深水型个体以环节动物(Annelida)和硅藻(Bacillariophyta)为主食,而沿岸型偏好鳞翅目昆虫(Lepidoptera)、蜉蝣(Ephemeroptera)和双壳类(Bivalvia)。该成果为理解同域物种形成(sympatric speciation)早期阶段的资源分配机制提供了分子生态学证据,凸显了咽颌形态可塑性(pharyngeal jaw plasticity)在生态适应中的关键作用。

  

ABSTRACT

同域物种形成(sympatric speciation)指无地理隔离条件下新物种的形成过程,但其基因组与生活史策略机制仍不明确。近期研究发现,坦桑尼亚马索科火山口湖的慈鲷Astatotilapia calliptera已分化为沿岸(浅水)与深水(深水)生态型,二者在头部和咽颌形态上存在差异。碳稳定同位素分析曾粗略提示其营养分化,而本研究通过胃内容物宏条形码技术,结合线粒体COI基因与真核生物核小亚基核糖体DNA(18S V4区),首次在精细尺度上揭示了生态型间的食性差异。

1 Introduction

慈鲷鱼类(约3000–4000种)是物种形成研究的经典模型,其非洲湖泊物种群为进化研究提供了天然实验室。Astatotilapia calliptera作为马拉维湖 haplochromine 辐射的祖先代表,在坦桑尼亚北部至少六个火山口湖(包括马索科湖)形成分化。马索科湖形成于约5万年前,目前为封闭湖泊,最大深度39米。该湖的A. calliptera种群约1万年前从河流系统殖民浅水区,1000年前扩展至深水区,分化为蓝色(深水)与黄色(浅水)雄性表型。

形态学研究表明,深水型个体具针状咽颌齿(papilliform jaws),适于浮游生物摄食;浅水型则具臼齿状咽颌(molariform jaws),适应硬壳无脊椎动物处理。稳定同位素分析显示二者碳氮比值差异,但无法解析具体猎物组成。本研究通过宏条形码技术,首次系统比较其胃内容物组成。

2 Materials and Methods

166份样本(74深水型/74浅水型/18中间型)的肠道内容物经盐析法提取DNA,使用Illumina MiSeq平台对COI和18S V4区进行双标记测序。数据经DADA2降噪,BLASTn比对NCBI数据库(分类阈值:门级80%/科级90%/种级97%)。使用phyloseq包进行α/β多样性分析,Horn-Morisita指数计算生态位重叠度,并建立广义线性模型(manyglm)评估体长与生态型对食性的影响。

3 Results

测序共获得2525万条序列(COI与18S各占一半)。α多样性显示浅水型与中间型食性多样性显著高于深水型(p<0.05)。β多样性分析证实生态型间食性差异显著(PERMANOVA,p<0.01)。深水型胃内容物以摇蚊科(Chironomidae)幼虫、寡毛纲(Naididae)和硅藻为主;浅水型则富含鳞翅目、蜉蝣、真菌(Ascomycota)及双壳类(Unionida/Venerida)。生态位重叠指数为0.3–0.33,提示部分资源共用但存在特化。体长与生态型的交互作用显著影响食性组成(p<0.05)。

4 Discussion

深水型通过摄食沉积物中的摇蚊幼虫和硅藻实现营养特化,其针状咽颌适于软体猎物处理;浅水型则利用臼齿状咽颌开发硬壳资源(如淡水蚌类)。二者共食浮游甲壳类(桡足类Copepoda),反映微生境资源的部分重叠。真菌与陆生昆虫在浅水型的出现,暗示其机会性摄食策略。这种"空间分配主导的资源分化"模式,与中美洲慈鲷Herichthys minckleyi的生态型分化机制相似。

研究局限性包括:1)宏条形码无法区分直接捕食与次级摄入;2)东非地区参考数据库覆盖不足;3)PCR扩增偏好性可能引入定量偏差。未来需结合eDNA监测与摄食实验,进一步解析咽颌可塑性在适应性辐射中的作用。

5 Conclusion

本研究通过多基因标记策略,揭示了A. calliptera生态型间显著的食性分化。深水型偏向底栖软体生物,浅水型特化于硬壳猎物,这种营养生态位分化可能驱动了同域物种形成的早期进程。后续研究应聚焦季节性能量流动与咽颌形态的功能基因组基础。

(注:全文严格依据原文数据,未添加非文献支持结论;专业术语如"papilliform/molariform jaws"等均按原文标注;上标如13C使用标准格式;去除了文献引用标识与图表标注)

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