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无标记蛋白质组学揭示秀丽隐杆线虫dvIs2(CL2006)阿尔茨海默病模型与人类AD脑的保守分子特征
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月31日 来源:Journal of Neurochemistry 4
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这篇研究通过无标记蛋白质组学技术,首次系统表征了表达Aβ1-42肽的秀丽隐杆线虫dvIs2(CL2006)阿尔茨海默病(AD)模型,鉴定出543个差异表达蛋白(DEPs)。通过跨物种比较分析发现29个上调蛋白和24个下调蛋白与人类AD患者微阵列数据存在保守关联,关键调控因子eEF-2在人类和线虫网络中均处于核心地位。研究揭示了蛋白质重折叠、分子伴侣、泛素化系统及糖代谢通路的异常激活,为AD机制研究和药物筛选提供了重要模型依据。
阿尔茨海默病(AD)作为最常见的痴呆类型,其复杂的分子机制使得动物模型成为研究关键。本研究首次对组成性表达Aβ1-42肽的转基因线虫dvIs2(CL2006)进行蛋白质组学分析,通过跨物种比较揭示了与人类AD保守的分子特征。
采用LC-MS/MS技术对L4期线虫进行蛋白质组检测,通过ImaGEO整合分析GSE48350等三个人类AD微阵列数据集。运用STRING构建蛋白质相互作用网络(PPI),CytoHubba鉴定关键节点,Ortholist筛选跨物种直系同源基因。
蛋白质组特征
在dvIs2(CL2006)中鉴定到543个DEPs(250上调/220下调),主成分分析显示组间显著分离(PC1=91%)。热休克蛋白HSP-16.41/25/16.48等显著上调,与人类AD中αB-crystallin变化趋势一致。泛素结合酶UBC-13上调反映蛋白质稳态失衡,而苹果酸脱氢酶MDH-2下调提示三羧酸循环障碍。
保守通路分析
基因本体(GO)富集显示:
生物过程:蛋白质重折叠(p<0.0001)、肌肉收缩
分子功能:未折叠蛋白结合(GO:0051082)、连接酶活性
KEGG通路:丙酮酸代谢(cel00620)、碳代谢
网络拓扑分析
人类AD网络中发现TP53/EGFR/eEF2等6个核心调控因子。线虫PPI网络关键节点eEF-2(下调)在两种物种中均处于调控中心,其氨基酸序列相似度达78.74%。模块分析显示:
模块1(score=22.8):含eEF-2和核糖体蛋白RPL-2
模块3:含分子伴侣CCT-1和脯氨酸合成酶ALH-13
模块5:糖酵解酶ENOL-1和TPI-1聚集
机制探讨
蛋白质稳态失衡:Aβ聚集触发HSPs上调,但无法完全抑制纤维形成
翻译抑制:eEF-2下调可能激活整合应激反应(ISR)
代谢重编程:线粒体损伤导致糖酵解酶代偿性升高
氧化应激:ALH-13上调可能通过脯氨酸合成抵抗氧化损伤
该研究首次建立dvIs2(CL2006)的蛋白质组图谱,揭示其与人类AD共享的保守分子特征,特别是eEF-2的核心调控作用。未来可结合荧光报告系统动态监测Aβ聚集过程,或通过CRISPR编辑构建更精准的神经特异性AD模型。尽管存在寿命缩短等局限性,该模型在药物筛选和机制研究方面仍具有独特优势。
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