基于SNP基因分型的非侵入性粪便样本杂交捕获技术优化及其在赤狐(Vulpes velox)重引入种群监测中的应用

来自蒙大拿州的研究人员通过设计特异性探针，开发出适用于赤狐(Vulpes velox)的非侵入性SNP基因分型技术。该研究利用溶液杂交捕获(en-solution hybridisation capture)方法，成功从粪便样本中获取85%成功率的多位点基因型数据，可精准识别个体、性别及种群结构，为野生动物重引入项目的成效评估提供创新监测工具。

　　

基因组学方法在过去二十年已成为野生动物种群研究的常规武器。尽管非侵入性遗传采样(noninvasive genetic sampling)技术自1990年代便崭露头角，但高通量测序技术的应用始终步履蹒跚。溶液杂交捕获技术独辟蹊径，能高效富集并测序那些降解严重、含量稀少且混杂大量外源DNA的样本（比如粪便），精准锁定目标序列。这项在古DNA领域大放异彩的技术，却在非侵入性样本应用中遭遇冷落。

最新研究突破性地证明：针对北美狐(Vulpes macrotis)设计的单核苷酸多态性(SNP)探针，竟在近亲物种赤狐(Vulpes velox)身上同样大显神通。科学家们通过四项创新探索：首先验证跨物种探针的多位点SNP分型及性别鉴定能力；其次计算样本间状态同一性(IBS)值评估个体区分度；接着探究重复索引PCR对分型成功率的影响；最后解析标记组在种群遗传结构推断中的表现。

在蒙大拿州Fort Belknap印第安保护区，这项技术以85%的成功率监测重引入赤狐种群。该方法不仅能追踪个体的扩散轨迹、存活状况和繁殖动态，更揭示了一个颠覆性发现：为某物种优化的探针竟可"跨界"应用于近缘物种。这项研究为野生动物种群研究开辟了新思路，其技术框架可推广至更多濒危物种的保护实践。

（注：动物伦理审批号SI-20-09/SI-23039，样本采集符合怀俄明州WGFD 13-1305许可要求）