维生素D结合蛋白基因功能性遗传变异与妊娠期糖尿病风险预测:基于中国人群的关联研究与列线图模型构建

【字体: 时间:2025年08月01日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究针对妊娠期糖尿病(GDM)遗传机制未明的关键问题,通过候选基因策略探究GC基因功能性变异(rs4752/rs3733359/rs7041)与GDM风险的关联。研究人员发现rs4752 AG基因型使GDM风险增加58%(OR=1.58),而rs7041 AC基因型降低27%风险(OR=0.73),并首次揭示这些变异可能通过影响转录因子结合(RAR-alpha/T3R-alpha)和mRNA剪接调控GDM易感性。创新性构建的列线图模型整合遗传与临床指标(FPG/HbA1c等),AUC达0.943,为GDM早期预警提供了高精度工具。

  

妊娠期糖尿病(GDM)作为最常见的妊娠代谢并发症,全球发病率已达2-20%,中国高达14.8%。这种疾病不仅增加先兆子痫、巨大儿等短期风险,更使母婴远期发生2型糖尿病(T2DM)的概率显著升高。尽管已知高龄、肥胖等临床危险因素,但约30%的GDM患者表现出家族聚集性,暗示遗传因素在发病机制中扮演关键角色。然而,现有预测模型多依赖临床指标,缺乏遗传标记的整合,制约了风险预警的精准度。

针对这一科学瓶颈,桂林医科大学公共卫生学院与广西环境暴露组学与全生命周期健康重点实验室的研究团队开展了一项病例对照研究。通过对567例GDM患者和710名对照者的基因型分析,首次系统评估了维生素D结合蛋白(GC)基因功能性变异与GDM的关联。研究发现rs4752 A>G变异通过创建新的mRNA剪接位点,使AG基因型携带者的GDM风险显著增加(OR=1.58, 95%CI:1.19-2.10),而rs3733359 G>A则通过改变RAR-alpha/T3R-alpha转录因子结合能力,使AA基因型具有保护效应(OR=0.70)。多因素降维分析(MDR)进一步揭示rs4752与rs7041存在基因-基因交互作用,共同构成最佳双位点预测模型。

研究采用的关键技术包括:1)基于Sequenom MassARRAY平台对GC基因4个功能性SNP(rs4752/rs3733359/rs4588/rs7041)进行基因分型;2)使用Alternative Splice Site Predictor(ASSP)和AliBaba 2.1工具预测变异对剪接调控和转录因子结合的影响;3)通过1000次Bootstrap重采样构建包含遗传变异(rs4752)和临床指标(FPG/OGTT等)的列线图预测模型。

Association between studied variants and GDM risk

数据分析显示,在调整年龄和孕前BMI后,rs4752 AG基因型使GDM风险增加58%(P=0.001),而rs7041 AC基因型具有27%的保护效应(P=0.015)。rs3733359 AA基因型则通过改变转录因子结合域,使风险降低30%(P=0.039)。

MDR analysis for variants interactions

交互作用分析表明,rs7041是最佳单位点模型,而rs4752-rs7041双位点组合具有最高预测准确度(测试平衡准确度0.5624),提示基因协同效应在GDM发生中的重要性。

Potential regulatory function analysis

生物信息学分析揭示,rs4752 G等位基因在DNA序列102bp处创建新的剪接位点,其剪接活性评分(5.602)与A等位基因(5.706)存在显著差异。rs7041 C等位基因则特异性激活106bp处的新型剪接位点,这些发现为解释遗传变异的功能后果提供了分子基础。

Predictive nomogram construction

最终构建的预测模型包含6个参数:年龄、FPG、OGTT1h、OGTT2h、HbA1c和rs4752基因型。该模型在训练集和验证集的AUC分别达到0.943和0.959,校准曲线显示预测概率与实际观察值高度一致,决策曲线分析证实其临床实用价值。

这项研究首次阐明GC基因变异通过转录调控和mRNA加工途径影响GDM易感性的分子机制,填补了维生素D代谢通路遗传因素与GDM关联的研究空白。所构建的遗传-临床整合预测模型突破传统仅依赖表型指标的局限,为GDM的精准预防提供了新思路。值得注意的是,虽然rs4752的加入使模型AUC提高0.02,但Delong检验显示未达统计学显著性(P=0.19),提示单个SNP对复杂疾病的贡献度有限,未来需扩大样本量并纳入更多遗传标记。研究也存在若干局限,如未能完全控制社会经济因素等混杂变量,且功能预测结果需通过分子实验进一步验证。这些发现为后续开展GDM分子流行病学研究和大规模队列验证提供了重要理论基础。

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