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基于WGCNA与单细胞测序的三羧酸循环相关基因(HPGD/G6PC)作为糖尿病肾病诊断标志物的鉴定与验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月01日 来源:Acta Diabetologica 2.9
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本研究针对糖尿病肾病(DN)诊断难题,通过整合加权基因共表达网络分析(WGCNA)和单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,首次系统鉴定了三羧酸循环(TCA)关键基因HPGD和G6PC作为新型诊断标志物。研究团队构建的预测模型在训练集和验证集中均展现优异诊断效能(AUC>0.85),并揭示DN患者免疫微环境活化特征,为早期干预提供了新靶点。
糖尿病肾病(DN)作为糖尿病最棘手的微血管并发症,其高发病率与致残率始终困扰临床诊疗。近年研究发现,三羧酸循环(TCA cycle)代谢重编程在DN进展中扮演关键角色,但相关基因的诊断价值尚未明确。
研究团队创新性地采用多组学整合策略:首先通过GSE131882数据集解析TCA相关基因在肾小球足细胞、近端小管上皮细胞等特定细胞群的表达特征;结合GSE30122队列筛选DN差异表达基因。运用单样本基因集富集分析(ssGSEA)和加权基因共表达网络分析(WGCNA)锁定关键模块后,采用机器学习算法从细胞和组织层面交叉验证,最终锚定HPGD(15-羟基前列腺素脱氢酶)和G6PC(葡萄糖-6-磷酸酶)这两个核心分子。
诊断模型构建显示,HPGD/G6PC联合检测在训练集和验证集的受试者工作特征曲线(ROC)下面积(AUC)分别达0.91和0.87。免疫浸润分析揭示DN组CD4+T细胞、M1型巨噬细胞显著富集,提示炎症反应参与疾病进程。通过GeneMANIA预测网络发现,这两个标志物与20个功能相关基因存在蛋白互作,并可能受59种microRNA和15个转录因子(TFs)调控。单细胞分辨率数据进一步证实,HPGD在肾小球系膜细胞高表达,而G6PC主要富集于近端小管S2段。
该研究不仅为DN早期诊断提供新型液体活检靶点,更揭示TCA循环代谢-免疫微环境串扰在DN发病中的重要作用。未来可探索HPGD/G6PC调控网络中的miR-29c-3p、SP1等分子作为治疗干预的潜在靶标。
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