人工智能揭示PNPLA3/MBOAT7/TM6SF2基因变异通过线粒体生物标志物驱动MASLD进展的机制及新型预测模型构建

【字体: 时间:2025年08月01日 来源:JHEP Reports 7.5

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  本研究针对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的遗传风险预测难题,创新性整合人工智能技术与线粒体生物学,发现PNPLA3/MBOAT7/TM6SF2基因变异通过p38/PGC-1α通路扰乱线粒体动力学,并鉴定D-loop和ccf-COXIII作为新型生物标志物。研究团队运用GPT-4开发的MAGIC-H预测模型(AUC>85%)显著提升了对肝癌风险的预测精度,为MASLD的精准分层提供了新范式。

  

代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)正成为全球肝病负担的主要贡献者,其疾病谱从单纯脂肪变可进展为脂肪性肝炎(MASH)、肝纤维化直至肝细胞癌(HCC)。尽管已知PNPLA3、MBOAT7和TM6SF2基因变异是MASLD的重要遗传决定因素,但这些变异如何影响疾病进展的分子机制尚不明确,且现有临床预测模型存在准确性不足的瓶颈。更棘手的是,约40%的MASLD相关肝癌发生在非肝硬化患者中,当前监测手段难以有效识别这类高危人群。

米兰大学医学与代谢疾病系(Medicine and Metabolic Diseases, Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico)的Miriam Longo领衔的研究团队在《JHEP Reports》发表了一项突破性研究。研究人员创新性地将人工智能技术与线粒体生物学相结合,通过多队列研究揭示了遗传变异干扰线粒体稳态的新机制,并开发出超越传统方法的预测系统。

研究采用透射电镜(TEM)和免疫组化(IHC)分析28例活检患者的肝组织(发现队列),在184例肝活检队列(肝脏验证队列)和824例血清样本队列(血清验证队列)中进行验证,最后在386例弹性成像诊断队列(非侵入性队列)中测试预测模型。关键技术包括:透射电镜观察线粒体超微结构、定量PCR检测线粒体D-loop和ccf-COXIII片段、定制化GPT-4(rsGPT-4)构建随机森林预测模型。

线粒体动力学异常在基因高危患者中的特征显示,携带PNPLA3/MBOAT7/TM6SF2三种风险变异(NRV=3)的患者肝脏线粒体数量增加70%、周长扩大40%,并出现独特的超微结构损伤,如双膜破裂和嵴结构紊乱。机制研究发现这些患者肝细胞内PGC-1α表达升高80%,伴随p38磷酸化激活,但线粒体自噬关键蛋白PRKN却减少50%,导致缺陷线粒体累积。

循环生物标志物的临床价值评估揭示,外周血单个核细胞中的D-loop水平与肝脏线粒体含量呈正相关(r=0.62),而血清ccf-COXIII在HCC患者中升高2.4倍。多因素分析显示,这两种生物标志物分别独立预测疾病进展(ORD-loop=1.31)和HCC风险(ORccf-COXIII=2.41)。

人工智能驱动的预测模型开发取得突破性进展。研究人员利用定制化GPT-4筛选关键变量,构建的MAGIC-H评分整合了年龄、BMI、遗传风险和线粒体标志物,在识别HCC时AUC达0.86,敏感性78.6%,特异性81.5%。值得注意的是,该模型对非肝硬化HCC的预测准确率仍保持82%,显著优于现有Fib-4等指标(p<0.01)。

这项研究首次系统阐明了MASLD主要遗传变异通过p38/PGC-1α通路扰乱线粒体质量控制的分子机制。创新点在于:发现线粒体D-loop可作为肝脏线粒体含量的外周标志物,ccf-COXIII则是晚期肝损伤的特异性指标;更开创性地将生成式AI应用于临床预测模型开发,使遗传风险信息转化为可操作的临床工具。研究提出的MAGIC评分系统实现了对传统监测盲区——非肝硬化HCC高危人群的识别,为MASLD的精准管理提供了新范式。这些发现不仅深化了对MASLD发病机制的理解,也为人工智能在肝病领域的应用树立了新标杆。

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