天津地区2017-2025年甲型流感病毒（pdm09 H1N1与H3N2）流行病学与基因组监测研究

本研究通过分析天津地区77,473份咽拭子样本，系统监测了2017-2025年甲型流感病毒（IAV）的流行病学特征与基因组演化规律。研究人员对241株临床分离株进行全基因组测序，发现pdm09 H1N1与H3N2亚型呈现季节性交替流行模式，鉴定出HA/NA关键氨基酸位点与宿主适应、传播力及奥司他韦耐药性相关，为流感防控提供分子预警依据。

　　

流感病毒作为全球公共卫生的重要威胁，每年导致数百万重症病例和数十万死亡。尽管疫苗和抗病毒药物已广泛应用，但病毒通过抗原漂移（antigenic drift）和基因重配（reassortment）持续进化，特别是2009年出现的甲型H1N1pdm09病毒与季节性H3N2病毒，其流行规律常受外部因素干扰——COVID-19大流行期间非药物干预措施（NPIs）的实施，就曾显著改变流感病毒的传播模式。更令人担忧的是，神经氨酸酶抑制剂（NAIs）耐药突变株的零星出现，以及HA蛋白关键位点变异导致的传播力改变，都凸显持续监测的必要性。

为应对这些挑战，天津市疾病预防控制中心微生物研究所的研究团队开展了为期8年的系统研究。通过对77,473例流感样病例（ILI）和严重急性呼吸道感染（SARI）患者的咽拭子样本进行分析，结合高通量测序和生物信息学技术，揭示了天津地区甲型流感病毒的流行规律和分子特征。相关成果发表在《Virologica Sinica》期刊。

研究主要采用四种关键技术：实时定量PCR（qPCR）用于病毒分型检测，MDCK细胞培养分离临床毒株，Illumina NextSeq 2000平台完成全基因组测序，以及基于BEAST软件的时间尺度系统发育分析。此外，血凝抑制试验（HI）和神经氨酸酶抑制试验（NAI）分别用于抗原性分析和药物敏感性评估。

流行病学特征
通过对2017-2025年监测数据的分析，研究发现天津地区呈现明显的季节性流行特征（除2020-2021年受COVID-19干预措施影响外）。9,144份IAV阳性样本中，pdm09 H1N1在婴幼儿（0-4岁）和老年人（≥65岁）中占比显著，而H3N2更易感染学龄儿童（5-14岁）。值得注意的是，2022年夏季出现反常的H3N2流行峰，提示气候变化可能影响传播模式。

基因组进化分析
128株pdm09 H1N1分离株均属于6B.1进化枝，但呈现出明显的时序分化：2017-2019年以6B.1A.1等多分支共存为特征，而2023年后毒株集中归于6B.1A.5a.2a分支的C.1.9亚型。H3N2毒株则从早期的3C.2a1-3分支，逐步演化为2024年主导的3C.2a1b.2a.2a.3a.1分支的J亚型。HA-NA基因重配事件在两类毒株中均有发现，如2023年一株H3N2出现罕见的A.2型NA基因。

分子风险标记
HA蛋白分析发现多个与宿主适应相关的时序性位点：pdm09 H1N1的Asn¹⁵⁹（2017-2019年）和Gln¹⁷²（2023年后）分别与受体结合能力相关；H3N2的HA1-133缺失和Val²²³被鉴定为新型毒力标记。NA基因检测到奥司他韦耐药相关突变H274Y（对应N1编号），两株2024-2025年分离株对此药敏感性降低10倍以上。

公共卫生意义
抗原性分析显示当前流行株与疫苗株（如A/Darwin/9/2021）仍保持良好匹配，但全球流行株间的抗原差异（如D.3亚型）提示需持续监测。该研究首次系统描绘了COVID-19大流行前后天津地区IAV的演化轨迹，建立的FluRisk风险评估模型（http://www.computationalbiology.cn/FluRisk）可为疫苗株选择和临床用药提供决策支持。

这项长达8年的动态监测不仅揭示了NPIs对流感病毒进化的深远影响，更构建了从分子特征到流行预测的完整研究框架。未来需扩大基因组监测覆盖度，并加强PA基因等片段分析以评估巴洛沙韦等新药的耐药风险。正如作者强调，在"同一健康"（One Health）理念下，这种多维度监测体系对应对"疾病X"（Disease X）威胁具有示范价值。