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海洋来源假大洋杆菌与莱辛氏菌全基因组解析:聚烯烃降解与生物塑料合成的双功能潜力
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月01日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.6
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来自日本的研究团队通过富集培养技术,从和歌山县白良浜海水中分离出两株具有聚烯烃降解潜力的海洋细菌——新型南极假大洋杆菌(Pseudooceanicola antarcticus)和莱辛氏菌属新种(Leisingera sp.)。全基因组测序揭示其携带烷烃降解基因(alkB)和聚羟基脂肪酸酯合成酶基因(PHA synthase),为海洋塑料污染治理及可降解塑料生产提供了新的微生物资源。
在应对全球海洋塑料污染的攻坚战中,科学家从日本和歌山县白良浜(33°40′53.0″N 135°20′39.0″E)的表层海水中捕获了两员"环境卫士"——菌株S2H3和S2M4。这些微生物经过含低分子量聚烯烃LUCANT HC-40的培养基特殊训练后,展现出惊人的塑料转化才能。
高通量测序技术(PacBio Revio系统)揭开了它们的基因密码本:S2H3被鉴定为南极假大洋杆菌的新菌株(与模式菌株ANI值达98.19%),其4.26 Mb染色体和36.5 kb质粒上驻扎着烷烃1-单加氧酶(alkane 1-monooxygenase)等降解武器;而S2M4作为莱辛氏菌属的新成员(与近缘种ANI仅84.24%),则携带3.39 Mb染色体和三个附属复制子(574.6 kb/250.2 kb/115.5 kb),基因组里暗藏着将塑料废料转化为聚羟基脂肪酸酯(PHA)的生物合成车间。
这些海洋微生物的"超能力"源于其基因工具箱:既能通过β-氧化途径瓦解聚烯烃的碳链,又能用I型PHA合酶将降解产物重组成环境友好的生物塑料。该发现为"白色污染"的微生物治理提供了新思路——让海洋细菌同时扮演"分解者"和"生产者"的双重角色,或许能开启塑料循环经济的新纪元。
(注:技术细节包括HiFi reads过滤采用Filtlong v0.2.1,组装使用Flye v2.9.3,注释通过DFAST v1.6.0完成;所有数据已存入NCBI,生物样本号SAMD00896922-3)
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