日本北部泥炭地Priestia aryabhattai KC-6A全基因组测序揭示耐逆性细菌的农业应用潜力

来自日本的研究团队针对泥炭地农业利用难题，完成了耐逆性细菌Priestia aryabhattai KC-6A的全基因组测序。该研究通过混合测序技术（Illumina/Nanopore）获得5.27 Mb高质量基因组（GC含量35.1%），包含1条染色体和4个质粒，与模式菌株B8W22T的ANI值为95.7%。该成果为开发耐酸、耐贫瘠环境的微生物肥料提供了重要基因资源。

　　

泥炭地作为典型的高酸、低无机质环境，夏季易发生有机质分解和氮素积累，传统农业开发面临严峻挑战。然而，这种特殊生态系统却蕴藏着宝贵的微生物资源。最新研究聚焦于从日本北海道（北纬43.22°，东经141.51°）泥炭地分离的Priestia aryabhattai KC-6A菌株，该菌株经16S rRNA测序（登录号PV436949）显示与模式菌株B8W22^T具有99.9%相似性。

研究团队采用创新性的混合测序策略：通过MGISEQ平台产生1.29Gb短读长数据（2×150bp），配合PromethION平台获取1.62Gb纳米孔长读长（N₅₀达10,143bp）。经Trycycler组装和Medaka抛光后，获得5个环状contig，总长度5,277,486bp。基因组注释显示包含5,095个编码基因（CDSs）、39个核糖体RNA（rRNAs）及113个转运RNA（tRNAs），CheckM评估基因组完整度达99.27%。

值得注意的是，该菌株携带4个特征性质粒（大小7.2-145.3kb），其中质粒3含有异常丰富的tRNAs（17个）。与Bacillus属近缘种比较基因组分析揭示，该菌株特有的耐酸代谢通路可能与其在泥炭环境中的适应性进化相关。这些发现为开发新型土壤改良微生物制剂提供了分子基础，特别适用于酸性土壤的生态修复。

研究获得日本新能源产业技术综合开发机构（NEDO）项目JPNP 21014支持，相关基因组数据已提交国际数据库，为后续功能基因组研究奠定基础。