基于凝血相关基因构建骨肉瘤免疫预测模型:揭示凝血系统与肿瘤微环境的交互机制

【字体: 时间:2025年08月02日 来源:Discover Oncology 2.9

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  针对骨肉瘤预后差、治疗靶点匮乏的临床困境,北京大学第一医院骨科团队通过整合TCGA/TARGET数据库,首次基于139个凝血相关基因(CRGs)建立骨肉瘤分子分型体系。研究发现CRGs高表达亚型具有更活跃的抗肿瘤免疫微环境(高ESTIMATE评分、低肿瘤纯度),并通过LASSO回归构建含25个基因的预后模型(AUC>0.8)。该研究为骨肉瘤免疫治疗提供新靶点,发表于《Discover Oncology》。

  

骨肉瘤作为儿童青少年最常见的原发性恶性骨肿瘤,尽管现代医学不断发展,其5年生存率仍停滞在60-70%。尤其令人担忧的是,约20%患者初诊时已发生肺转移,这类患者生存率骤降至30%。传统化疗方案近20年未见显著突破,亟需从全新角度探索预后标志物和治疗靶点。近年来,凝血系统(Coagulation system)与肿瘤的关联逐渐引起关注——从黑色素瘤到肺癌,凝血因子异常已被证实参与肿瘤进展、转移和免疫逃逸,但这一机制在骨肉瘤领域仍属空白。

北京大学第一医院骨科团队联合华中科技大学医药卫生管理学院,在《Discover Oncology》发表重磅研究。研究人员创新性地从凝血-免疫交互视角切入,利用TCGA/TARGET数据库86例样本和GTEx数据库53例正常组织数据,首次构建了基于凝血相关基因(CRGs)的骨肉瘤免疫预测模型。

研究采用多组学整合分析策略:1)通过共识聚类(ConsensusClusterPlus)基于139个CRGs划分分子亚型;2)运用TIMER/CIBERSORT等7种算法解析肿瘤免疫微环境(TIME);3)结合LASSO回归和Cox分析建立预后模型;4)通过GO/KEGG/PPI网络揭示功能机制。关键发现包括:CRGs定义的Cluster1亚型患者生存期显著优于Cluster2(P<0.05),其免疫评分高出47%、肿瘤纯度降低32%,且CD8+T细胞等效应免疫细胞浸润更丰富(ssGSEA/P<0.01)。差异基因分析显示,ECM重塑和"金黄色葡萄球菌感染"通路异常激活可能是预后差异的关键。

技术方法亮点:1)跨平台整合TCGA/TARGET/GTEx数据,经sva包校正批次效应;2)采用ESTIMATE算法量化肿瘤纯度与免疫/基质组分;3)通过28种免疫细胞ssGSEA评分解析免疫景观;4)LASSO回归从139个CRGs中筛选25个核心基因构建风险模型;5)建立包含ITIH1等基因的Nomogram临床预测工具。

主要研究结果:

  1. 分子分型揭示预后差异

    共识聚类确定K=2为最优分型,Cluster1(n=90)较Cluster2(n=49)展现显著生存优势(HR=2.3, P<0.01)。热图显示两组CRGs表达谱存在明显分化,提示凝血系统异质性影响预后。

  2. 免疫微环境特征解析

    Cluster1呈现"热肿瘤"特征:免疫检查点基因(PD-L1等)表达量提升2.1倍,HLA家族基因上调1.8倍,细胞溶解活性评分(CYT)增加63%(均P<0.001)。TIMER分析显示该组CD8+T细胞浸润度较Cluster2高55%。

  1. 功能机制探索

    137个差异基因主要富集于ECM组织(FDR=1.2E-6)和补体激活通路(FDR=3.4E-5)。PPI网络鉴定出ITIH1等10个枢纽基因,其中ITIH1在GBM等5种癌症中异常高表达且与不良预后相关(HR=1.7, P=0.003)。

  2. 临床转化应用

    25基因风险模型在训练集/验证集的5年预测AUC达0.814/0.782。结合转移状态的Nomogram校准曲线斜率接近1,显示优异临床适用性。值得注意的是,ITIH1高表达组BAP1基因突变率增加2.4倍,提示潜在协同致癌机制。

这项研究开创性地揭示了凝血系统通过调控TIME影响骨肉瘤预后的新机制:凝血因子异常可能通过ECM重塑和补体激活塑造免疫抑制微环境,而ITIH1等基因的发现为"凝血-免疫"双靶点治疗提供理论依据。该成果的临床价值在于:1)首次建立CRGs指导的骨肉瘤分层治疗体系;2)鉴定ITIH1等可干预靶点,已有相关抑制剂(如AZ3451)处于研发阶段;3)创新性融合凝血指标与免疫治疗响应预测。未来需在类器官模型和前瞻性临床试验中验证这些发现,推动骨肉瘤精准治疗进入"凝血免疫"新时代。

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