综述：斑秃病变头皮核心转录组特征的基因表达荟萃分析

这篇综述通过荟萃分析整合5项基因表达数据集，首次系统定义了斑秃（AA）病变头皮的核心转录组特征，揭示了2710个上调基因（如CXCL9、CCL18）和2399个下调基因（如KRT31-35），证实了Th1/Th2/Th17通路及JAK-STAT信号的关键作用，为靶向治疗（如JAK抑制剂）提供了分子依据。

　　

引言

斑秃（AA）是一种以毛囊为靶点的免疫介导炎症性皮肤病，全球患病率达0.5-2%。尽管既往研究揭示了Th1/IFNγ轴的核心作用，但基因表达结果存在显著异质性。本研究通过荟萃分析整合5项微阵列数据集（共132例样本），首次系统描绘了AA病变的核心转录组图谱。

方法

研究纳入GEO数据库中5项使用Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array平台的研究（GSE68801等），采用随机效应模型和ImaGEO工具进行数据整合。通过GeneCodis进行功能富集分析，重点关注FDR<0.05的差异表达基因（DEGs）。研究方案已在PROSPERO注册（CRD42024559847）。

结果

核心转录组特征

• 上调基因：2710个，突出表现为趋化因子（CXCL9/CXCL10/CCL13）和细胞毒性标志物（GZMB/CD8A/NKG2D）。
• 下调基因：2399个，主要为I/II型角蛋白（KRT31-35/KRT81-86）和毛囊结构蛋白（PADI3/DSG4）。
• 关键通路：Th1/Th2/Th17分化、JAK-STAT信号（p<0.01）及TLR/NF-κB通路显著激活，而Wnt和角质化通路被抑制。

跨数据集验证
仅28个上调基因（如CD8A）和92个下调基因（如KRTAP）在所有研究中重复出现，而荟萃分析额外发现ZAR1、PADI3等新型候选基因。与RNA-seq数据（GSE111061）比较显示50%重叠率，CXCL9/CXCL10等位列前100 DEGs。

讨论

治疗靶点启示

• 现有靶点验证：JAK抑制剂（如鲁索替尼）通过抑制CXCL9/CXCL10表达显示疗效。
• 潜在新方向：Th2趋化因子CCL18和IL-23A提示IL-4/IL-13或IL-23抑制剂可能对特定亚型有效。
• 结构修复：角蛋白和PADI3下调反映毛囊免疫豁免破坏，其恢复程度可作治疗应答标志物。

技术优势与局限
研究通过大样本整合解决了单一研究统计效力不足的问题，但未纳入RNA-seq数据和单细胞分辨率分析。未来需结合空间转录组技术解析细胞互作网络。

结论

该研究确立了AA的首个核心转录组框架，为精准医疗提供了分子基础。靶向JAK-STAT和多重免疫通路的联合策略或将成为未来研究方向。