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跨界RNA通讯:植物源sRNA调控细菌毒力的新机制及其在抗病防御中的意义
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月02日 来源:TRENDS IN Genetics 16.3
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植物如何精准抑制细菌毒力?最新研究发现拟南芥通过胞外小RNA(sRNA)介导的"抗菌基因沉默"(AGS)机制,靶向调控Pseudomonas syringae的毒力基因cfa6和rpL,揭示植物-细菌互作中跨界RNAi的新范式,为开发非转基因抗病策略提供理论依据。
在植物与微生物的军备竞赛中,RNA分子正成为意想不到的"隐形武器"。传统认知认为,植物只能通过分泌抗菌蛋白或活性氧等化学物质对抗细菌入侵,而原核生物因缺乏真核生物的RNA干扰(RNAi)核心组件,长期被视为"免疫"于植物的RNA防御系统。然而,德国汉堡大学(University of Hamburg)的Arne Weiberg团队在《TRENDS in Genetics》发表的研究颠覆了这一认知,揭示植物竟能通过分泌特殊形式的小RNA(sRNA)穿透细菌细胞壁,精准沉默病原菌的毒力基因——这种被称为"抗菌基因沉默"(Antibacterial Gene Silencing, AGS)的机制,为理解植物免疫提供了全新视角。
研究人员采用多组学联合作战策略:通过构建靶向细菌毒力基因cfa6(冠菌素合成相关)和rpL(III型分泌系统调控因子)的转基因拟南芥,结合dcl2/dcl3/dcl4三突变体验证sRNA功能;运用p19蛋白特异性结合双链sRNA的特性进行pull-down测序;采用半体外气孔 reopening 实验评估细菌侵染能力;并通过高通量测序鉴定内源性tRNA衍生sRNA(tRFs)的跨界调控作用。
突破性发现1:植物sRNA的三种"作战形态"
研究首次系统鉴定植物分泌的胞外sRNA存在三种物理形态:(1)与蛋白质结合的sRNA复合体;(2)胞外囊泡(EVs)内包裹的sRNA(标记蛋白为TET8和PEN1);(3)裸露的双链"自由sRNA"(efsRNA)。令人惊讶的是,这些缺乏保护的efsRNA竟能在植物质外体环境中保持稳定,且所有三种形态均能被P. syringae摄取并抑制气孔 reopening。
突破性发现2:内源性tRNA片段的自然防御
通过转录组分析发现,拟南芥在细菌侵染或水杨酸(SA)处理时会特异性上调一组tRNA衍生sRNA(tRFs),这些内源性tRFs与P. syringae的多个基因存在序列互补性。更关键的是,在SA诱导条件下,这些tRFs预测靶基因的蛋白表达水平确实下降,证实植物天然存在利用sRNA干扰原核病原体的进化策略。
机制猜想:细菌RNase E或是"特洛伊木马"
尽管细菌缺乏典型RNAi机制,但研究发现植物sRNA可能通过以下途径发挥作用:(1)作为反义RNA与细菌mRNA配对阻断翻译;(2)通过细菌RNase E等核酸酶促进靶mRNA降解;(3)类似Hfq蛋白介导的细菌非编码RNA调控途径。这解释了为何植物sRNA能"借用"细菌原有RNA代谢通路实现基因沉默。
这项研究将跨界RNAi的疆域扩展到原核生物领域,其意义远超学术认知:首先,AGS机制可发展为精准抗病策略,通过设计sRNA混合物靶向多个毒力基因,类似抗生素联合疗法;其次,植物天然tRFs的发现为开发非转基因抗病作物提供新思路;最后,该研究暗示微生物组调控可能普遍存在RNA通讯,正如人类肠道菌群与宿主的exRNA交流假说。正如文中所言:"每一条sRNA都像一道精准的基因指令,悄然关闭病原菌的危险武器库"。

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