基于基底膜相关基因的结直肠癌分子分型及预后特征研究

【字体: 时间:2025年08月03日 来源:Journal of Applied Genetics 1.9

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  近期研究表明基底膜(BM)在结直肠癌(CRC)进展中起重要作用。研究人员通过分析TCGA数据库和文献获取BM相关差异表达基因(DEGs),构建了包含7个基因(AGRN、TIMP1等)的预后模型,该模型能独立预测CRC患者预后,并揭示高风险组更适合免疫治疗,低风险组对吉西他滨和顺铂更敏感。该研究为CRC预后预测和个体化治疗提供了新思路。

  

最新研究发现,基底膜(basement membrane, BM)在结直肠癌(colorectal cancer, CRC)的发展进程中扮演着关键角色。科研团队通过挖掘癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)公共数据库并结合文献调研,成功筛选出BM相关的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)。基于这些分子标志物,研究人员将CRC样本划分为两个具有显著生存差异的亚型,其中cluster 1组患者预后较差。

通过回归分析构建的7基因预后特征模型(包含AGRN、TIMP1、UNC5A等关键基因)展现出优异的预测效能。风险评分(riskscore)越高提示肿瘤进展程度越严重。值得注意的是,高风险组(high-risk, H)表现出更活跃的免疫浸润状态和更高的肿瘤突变负荷(tumor mutation burden, TMB),这暗示该群体可能更适合接受免疫治疗。而低风险组(low-risk, L)患者则对化疗药物吉西他滨(Gemcitabine)和顺铂(Cisplatin)表现出更好的治疗响应。

研究团队还采用单样本基因集富集分析(single sample Gene Set Enrichment Analysis, ssGSEA)和ESTIMATE算法解析了不同风险组的免疫微环境特征。定量PCR(qPCR)实验验证了特征基因的表达模式与数据库结果高度一致。这项创新性工作不仅建立了可靠的BM相关预后评估体系,更为CRC患者的精准治疗决策提供了重要依据,特别是在免疫治疗和化疗方案选择方面具有重要临床指导价值。

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