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猪全基因组关联研究揭示维生素D代谢物与骨重塑标志物的遗传调控机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月03日 来源:BMC Genomics 3.7
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本研究针对猪骨骼健康与矿物质利用效率的遗传基础,通过全基因组关联分析(GWAS)揭示了血清钙化二醇(calcidiol)、钙化三醇(calcitriol)及骨重塑标志物β-CTX和CICP的遗传调控网络。研究人员在610头德国长白猪中鉴定出17个显著关联基因组区域,发现PTH、GC、BTG1等23个关键候选基因,为育种策略优化提供新靶点。成果发表于《BMC Genomics》,为畜禽骨骼健康育种和人类骨代谢研究提供重要参考。
在畜禽养殖业中,骨骼健康直接关系到动物福利与生产效益,而维生素D代谢与骨重塑过程的个体差异长期困扰着育种实践。猪作为与人类生理高度相似的大型模型,其血清中维生素D储存形式钙化二醇(25(OH)D3)和活性形式钙化三醇(1,25(OH)2D3)的浓度波动,以及骨吸收标志物β-CTX和骨形成标志物CICP的水平变化,背后可能隐藏着关键的遗传密码。德国农场动物生物学研究所(FBN, Research Institute for Farm Animal Biology)的研究团队通过大规模群体分析,首次系统解析了这些性状的遗传架构。
研究人员采用全基因组关联研究(GWAS)技术,对610头纯种德国长白猪进行60K SNP芯片检测,结合ELISA法测定血清标志物浓度。通过贝叶斯统计模型计算基因组遗传力,利用ECMLM算法校正群体结构,定位显著关联的SNP位点,并基于500kb窗口筛选候选基因。
表型变异特征
血清钙化二醇(31.60±3.07 ng/ml)和钙化三醇(224.97±33.54 pmol/L)呈现显著个体差异,β-CTX(0.32±0.02 ng/ml)与CICP(44.92±4.53 ng/ml)的波动范围分别达24倍和23倍,凸显遗传分析的迫切性。
遗传力与相关性
基因组遗传力估计显示:钙化二醇(0.14)、钙化三醇(0.12)、β-CTX(0.15)和CICP(0.12)均属中等遗传力性状。值得注意的是,钙化二醇与β-CTX存在显著负遗传相关(-0.35),暗示维生素D可能通过抑制破骨细胞活性调控骨吸收。
关键基因发现
维生素D代谢调控:染色体8上68.3Mb处的GC基因(编码维生素D结合蛋白)和69.5Mb的ALB基因(白蛋白)多态性显著影响钙化二醇水平;染色体6的PDPN基因与钙化三醇关联,该基因已知调控骨细胞树突形成。
骨重塑调控:染色体5的BTG1基因(90.3Mb)与β-CTX相关,其缺失会导致小鼠脊柱发育异常;染色体12的FASN(脂肪酸合酶)和FOXK2基因通过调节脂肪-成骨细胞分化平衡影响骨吸收。
骨形成通路:染色体3的RETSAT(视黄醇饱和酶)和ATOH8基因通过BMP信号通路调控CICP分泌,其中ATOH8可抑制破骨细胞分化关键因子Rankl的表达。
这项研究构建了首个猪维生素D-骨代谢调控网络图谱,发现GC、ALB等人类同源基因的保守作用,证实猪模型在骨代谢研究中的转化价值。鉴定出的BTG1、FASN等新靶点为抗骨质疏松药物开发提供线索,而中等遗传力的确认支持将血清标志物纳入育种选择指标。特别值得注意的是,钙化二醇与β-CTX的遗传拮抗现象提示,过量维生素D补充可能干扰骨重塑平衡,这对畜禽营养方案制定具有直接指导意义。研究成果为理解哺乳动物矿物质稳态的进化保守性提供了重要证据,相关发现已通过欧洲变异档案(EVA PRJEB88145)公开共享。
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