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利用前生命甲酰胺化学开发新型抗病毒平台:一种进化启发的探索策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月03日 来源:Scientific Reports 3.9
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本研究创新性地利用甲酰胺前生命化学模型,通过引入乳清酸衍生物作为"掺杂剂",构建了非天然化学混合物库,成功筛选出对多种病毒(WNV、DENV、HIV-1、IAV和SARS-CoV-2)具有广谱抑制活性且细胞毒性低的候选混合物。该研究为抗病毒药物开发提供了进化启发的全新策略,突破了传统单一化合物筛选的局限,发表于《Scientific Reports》。
在生命起源的混沌时期,病毒与宿主细胞可能共享着由简单无机分子演化而来的共同"化学语言"。这种源于前生命环境的分子对话,历经数十亿年进化后,是否能为现代抗病毒策略提供全新思路?意大利帕尔马大学(Università degli Studi di Parma)的研究团队独辟蹊径,通过逆向工程模拟早期地球化学环境,构建出能干扰现代病毒复制的非天然分子库,相关成果发表在《Scientific Reports》上。
当前抗病毒药物研发面临两大瓶颈:一是病毒快速变异导致的耐药性问题,二是传统单靶点策略难以应对新发病毒威胁。该研究创新性地提出"进化重编程"概念——通过改造甲酰胺(formamide)前生命化学模型,人为创造自然界未曾选择的化学空间。研究人员采用微波辅助多组分反应(MCRs),在模拟早期地球环境(180°C,水/戊醇溶剂)中将三种乳清酸衍生物"掺杂"入甲酰胺反应体系,生成12种化学混合物(Mix1a-d至Mix3a-d)。通过平行人工膜渗透实验(PAMPA)和液相色谱-质谱联用(LC-UV/MS)技术,发现Mix1c对西尼罗河病毒(WNV)和登革热病毒(DENV)的半数抑制浓度(IC50)分别达3.3μg/mL和7.2μg/mL,选择性指数(SI)最高达19.5。
关键实验技术包括:1)微波辅助多组分反应构建化学库;2)细胞毒性(CC50)和抗病毒活性(IC50)双参数筛选;3)LC-UV/MS和PAMPA联用解析混合物组分;4)亚组分分离与重构实验验证协同效应。
设计进化启发的研究方法
团队突破性地将前生命化学模型转化为药物发现平台,通过引入非天然"掺杂剂"(doping agents)改变反应路径。如图1所示,该四步策略包含:化学库构建→水醇可溶组分分离→多病毒表型筛选→活性混合物解析。实验证实戊醇溶剂环境更利于生成活性混合物,Mix1c在MDCK细胞中对流感病毒(IAV)的SI高达62.8。
非天然前生命混合物的生成与筛选
如表1所示,不同溶剂(水/戊醇/甲酰胺)和加热时间(5min-1h)显著影响产物谱。Mix1c和Mix3c表现出广谱活性,对SARS-CoV-2的IC50为3.6μg/mL(表2-3)。值得注意的是,色谱分离得到的单个亚组分(Fr1-Fr6)完全丧失活性,而重构混合物(Mix1c-R)能恢复部分抗病毒效果(表4),揭示独特的协同作用机制。
分析研究与亚组分筛选
通过标准品添加法鉴定出Mix1c主要成分(图2),其中峰C对应化合物4(图4)。但令人意外的是,这个最具膜渗透性(Papp=9.84×10-6 cm/sec)的单一组分却无抗病毒活性(图3),说明活性源于多分子协同。
这项研究开创性地证明:1)改造的前生命化学系统可生成非自然选择分子库;2)混合物整体活性优于单一组分,提示"化学复杂性"本身可能成为抗病毒新策略;3)甲酰胺基反应体系对RNA病毒(包括包膜与非包膜病毒)具有广谱抑制作用。该发现为应对新发传染病提供了全新思路——通过模拟生命起源的化学多样性,开发能同时靶向多病毒保守机制的"进化颠覆者"。正如作者强调,这种方法不同于传统药物设计,它拥抱化学复杂性,在分子协同中寻找对抗简单病毒系统的"群体智慧"。未来研究可进一步优化掺杂剂结构和反应条件,在保持低毒性的同时提升抗病毒效力。
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