
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
基于扩散模型的成像质谱无标记组织虚拟染色技术突破:实现10倍超分辨率的分子病理学分析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月03日 来源:SCIENCE ADVANCES 12.5
编辑推荐:
针对成像质谱(IMS)空间分辨率低、缺乏组织形态学对比度的难题,研究人员开发了基于布朗桥扩散模型(BBDM)的虚拟染色技术,将10 μm像素的IMS数据转化为1 μm级虚拟PAS染色图像,经病理学家验证可准确识别肾小球等关键结构。该技术无需化学染色即可获得与组织化学染色高度一致的高分辨图像,为分子病理学研究提供了创新工具。
在生物医学研究领域,成像质谱技术(IMS)因其能同时检测组织中上千种分子的空间分布而备受瞩目,但这项技术长期面临两大瓶颈:一是空间分辨率有限(通常为10-30 μm),远低于光学显微镜;二是缺乏组织形态学对比,使研究人员难以将分子信息与特定组织结构对应。传统解决方案需要对同一样本先后进行IMS检测和组织化学染色,不仅流程繁琐,更关键的是化学染色会破坏样本,阻碍后续分子分析。如何在不损伤样本的前提下,直接从低分辨率IMS数据重建出高分辨率的组织学图像,成为困扰学界多年的技术难题。
针对这一挑战,范德堡大学医学中心(Vanderbilt University Medical Center)的研究团队在《SCIENCE ADVANCES》发表了一项突破性研究。他们创新性地将扩散模型应用于IMS数据分析,开发出基于布朗桥扩散过程(BBDM)的虚拟染色框架,成功实现了从10 μm像素的IMS数据生成1 μm分辨率、与真实PAS染色高度一致的虚拟图像,在保持组织完整性的同时,为分子病理学研究提供了全新的技术路径。
研究团队运用了多项关键技术:首先建立包含人类肾组织IMS数据(1453个m/z通道)与对应PAS染色图像的配对数据集;开发基于U-Net的布朗桥扩散模型,通过前向扩散和逆向去噪过程实现图像超分辨率和跨模态转换;创新性地采用均值采样策略降低输出变异;通过多模态图像配准(包括自发荧光显微成像)确保训练数据对齐;并系统评估了不同质谱通道数对虚拟染色效果的影响。
【虚拟组织学染色结果】
研究显示,基于10 μm IMS数据生成的虚拟染色图像在颜色分布(YCbCr空间Hellinger距离<0.1)、对比度(P<2.6×10-15)和空间频率谱(相对误差6.7±4.84%)等方面均与真实PAS染色高度吻合。病理学家验证证实,虚拟图像能准确识别肾小球(G)、近曲小管(P)和远曲小管(D)等关键结构。
【质谱通道数优化】
通过系统分析不同m/z通道数(1453至23通道)的影响,发现信噪比(SNR)导向的通道选择策略最优,即使仅使用64分之一的通道(23个),模型仍能保持较好的染色效果(PSNR>24,LPIPS<0.25),表明IMS数据蕴含丰富的形态学信息。
【噪声采样工程】
比较vanilla、均值和跳跃采样策略显示,均值采样在保留图像质量(LPIPS最低)的同时,显著降低了输出变异(CV降低50%),最优退出时间点为te=10,为临床应用提供了稳定可靠的解决方案。
【技术优势与局限】
相较于传统生成对抗网络(GAN),扩散模型在极端超分辨率(10倍)任务中表现更优,避免了模式坍塌问题。虽然在大集合管等罕见结构重建上存在局限,但对常规肾皮质结构的还原度已满足诊断需求。研究同时指出,该技术当前主要适用于研究场景,因IMS尚未获FDA批准用于临床诊断。
这项研究的科学价值在于:首次实现了从低分辨率分子数据到高分辨率形态学图像的直接转换,突破了IMS技术的固有局限;建立的BBDM框架为多模态医学图像分析提供了新范式;通过保留样本完整性,支持后续多组学分析,有望推动空间多组学的发展。随着1 μm超高分辨率IMS技术的进步,该方法将进一步提升在精密诊断中的应用潜力,为肾脏疾病等组织特异性病变的分子机制研究开辟新途径。
生物通微信公众号
知名企业招聘