"亚洲首株完整基因组测序:揭示硝化单胞菌W4的乙醇胺代谢Eut BMC机制及其环境应用潜力"

【字体: 时间:2025年08月03日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.6

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  来自中国的研究人员成功分离并完成硝化单胞菌(Nitrosomonas europaea)W4的全基因组测序,发现其编码的Eut细菌微区室(BMC)具有乙醇胺代谢功能。该研究通过PacBio和Illumina双平台测序技术获得高质量基因组数据,比较分析显示与参考菌株ATCC 19718存在显著差异。研究成果为优化高生物量发酵及废水处理应用提供关键基因组基础。

  

在中国中山市石岐河分离的硝化单胞菌(Nitrosomonas europaea)W4迎来重大研究突破!科研团队采用创新性的96孔板培养法,搭配无机液体培养基成功驯化这株难培养菌。通过PacBio Sequel IIe和Illumina NovaSeq6000双剑合璧,获得覆盖度高达390×的基因组数据——染色体2,892,991bp搭配55,583bp质粒的完美组合,GC含量51.26%的基因组藏着2,716个编码基因。

最令人兴奋的是,基因组注释发现了神秘的Eut细菌微区室(Eut BMC)基因簇,这个细胞内的"纳米工厂"能高效分解乙醇胺,为废水脱氮提供新武器。相比NCBI唯一参考菌株ATCC 19718,亚洲新菌株展现出97.7%的相似度,但藏着独特的代谢密码。研究人员运用NextDenovo进行基因组环化,配合Artemis可视化工具,像拼图大师般重构了基因组全貌。

这项研究不仅填补了亚洲硝化单胞菌基因组空白,更揭示了Eut BMC在环境修复中的巨大潜力。从石岐河的潺潺流水中,科学家们钓出了可能改变废水处理技术的"基因宝藏"!

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