FDA批准药物靶向脓肿分枝杆菌水杨酸合成酶的药物重定位策略:以铁摄取干扰为突破点的抗感染新途径

【字体: 时间:2025年08月04日 来源:Chemical Biology & Drug Design 3.3

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  这篇研究通过计算机虚拟筛选和体外实验验证,创新性地将FDA已批准药物(如fostamatinib、esomeprazole和hydroxystilbamidine)重定位为脓肿分枝杆菌(Mab)水杨酸合成酶(SaS)的竞争性抑制剂,靶向铁摄取关键通路。该策略突破传统抗生素研发瓶颈,为治疗非结核分枝杆菌(NTM)感染提供高效低毒的"抗毒力"(anti-virulence)方案,尤其适用于囊性纤维化(CF)等易感人群。

  

ABSTRACT

非结核分枝杆菌(NTM)已成为免疫缺陷人群肺部感染的重要病原体,其中脓肿分枝杆菌(Mycobacterium abscessus, Mab)因对现有抗生素的广泛耐药性备受关注。铁代谢作为其关键毒力因子,通过水杨酸合成酶(SaS)催化的分枝杆菌素(mycobactin)生物合成途径实现,该靶点因人类基因组中缺失而具有高度特异性。研究采用"靶点导向"的药物重定位策略,通过计算机虚拟筛选3个FDA药物数据库,结合分子力学/广义波恩表面积(MM-GBSA)能量计算,从3400个化合物中锁定11个潜在抑制剂。

Results and Discussion

基于Mab-SaS晶体结构(PDB ID: 8QIJ)的分子对接显示,fostamatinib的磷酸基与Arg407形成离子键,hydroxystilbamidine通过盐桥与催化残基Glu254结合,esomeprazole则与Gly272/Thr273形成氢键网络。体外酶活实验证实三者均为竞争性抑制剂,Ki值分别为11.7±0.7 μM、5.4±0.5 μM和3.7±0.4 μM。分子动力学(MD)模拟显示药物结合使蛋白RMSD波动降低40%,显著稳定酶结构。值得注意的是,hydroxystilbamidine在缺铁条件下对耻垢分枝杆菌(M. smegmatis)的MIC达250 μM,展现潜在抗菌活性。

Experimentals

采用Schr?dinger 2025-1套件的OPLS_2005力场进行200 ns分子动力学模拟,酶活检测使用荧光法(Ex. λ=305 nm, Em. λ=410 nm)。为排除假阳性干扰,实验特别加入牛血清白蛋白(BSA)和Triton X-100验证抑制剂特异性。

Conclusions

该研究突破性地将抗风湿药(fostamatinib)、质子泵抑制剂(esomeprazole)和抗真菌药(hydroxystilbamidine)重定位为抗NTM候选药物。这种靶向铁摄取的非杀菌策略可避免选择压力,为开发抗耐药菌感染提供新范式。研究获得意大利Cariplo基金会和囊性纤维化研究基金会支持,其"计算机预测-体外验证"的研究框架为加速抗菌药物开发提供模板。

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